Контакты
Запись на прием
Научно-исследовательский институт акушерства, гинекологии и репродуктологии им. Д.О.ОттаНаучно-исследовательский институт акушерства, гинекологии и репродуктологииим. Д.О.Отта

Научно-исследовательская работа ФГБНУ "НИИ АГиР им. Д.О. Отта"

Лаборатория пренатальной диагностики наследственных и врожденных заболеваний

Основные направления исследований

  1. Генетика и цитогенетика эмбрионального развития человека в норме и патологии, пренатальная диагностика.
  2. Генетическое тестирование и Генетическая карта репродуктивного здоровья.
  3. Молекулярные основы патогенеза ряда моногенных и некоторых частых мультифакторных заболеваний.
  4. Разработка научных основ генной терапии.

Наиболее значимые результаты для науки и практики

  1. Создано новое научное направление «Цитогенетика эмбрионального развития человека».
  2. Заложены основы предиктивной, персонализированной медицины и сформулирована концепция Генетического паспорта.
  3. Разработаны оригинальные методы генного, хромосомного и биохимического анализа, создана служба пренатальной диагностики наследственной и врожденной болезней в г. Санкт-Петербурге.
  4. Научно обоснован подход системной генетики и концепция «эпигенетического ландшафта» в изучении патогенеза эндометриоза и миомы матки.
  5. Разработаны новые невирусные способы направленной доставки генных конструкций в клетки с целью  генной терапии эндометриоза.
  6. Получены новые данные о структурно-функциональной организации генома в гаметогенезе и эмбриогенезе человека.

Перспективы научных исследований

  1. Новые биомаркеры частой акушерской патологии и нарушений репродуктивной функции.
  2. Особенности экспрессии генов эндометрия и миометрия в норме и патологии.
  3. Неинвазивная диагностика хромосомных болезней у плода человека.
  4. Лечения эндометриоза с помощью генной терапии в эксперименте на модельных системах.
  5. Сравнительный анализ особенностей эпигенома зародышей человека до и после имплантации.

Основные научные работы

  1. Glotov, A.S., Kazakov, S.V., Zhukova, E.A., Alexandrov, A.V., Glotov, O.S., Pakin, V.S., Danilova, M.M., Poliakova, I.V., Niyazova, S.S., Chakova, N.N., Komissarova, S.M., Kurnikova, E.A., Sarana, A.M., Sherbak, S.G., Sergushichev, A.A., Shalyto, A.A., Baranov, V.S. Targeted next-generation sequencing (NGS) of nine candidate genes with custom AmpliSeq in patients and a cardiomyopathy risk group // Clinica Chimica Acta (2015), 446, pp. 132-140.
  2. Zheleznyakova, G.Yu., Nilsson, E.K., Kiselev, A.V., Maretina, M.A., Tishchenko, L.I., Fredriksson, R., Baranov, V.S., Schiöth, H.B. Methylation levels of SLC23A2 and NCOR2 genes correlate with spinal muscular atrophy severity // PloS ONE (2015), 10 (3), art. No. e0121964.
  3. Efimova OA, Pendina AA, Tikhonov AV, Fedorova ID, Krapivin MI, Chiryaeva OG, Shilnikova EM, Bogdanova MA, Kogan IY, Kuznetzova TV, Gzgzyan AM, Ailamazyan EK, Baranov VS. Chromosome hydroxymethylation patterns in human zygotes and cleavage-stage embryos. // Reproduction. 2015; 149 (3): 223-233.
  4. Baranov, V.S., Ivaschenko, T.E., Liehr, T., Yarmolinskaya, M.I. Systems genetics view of endometriosis: A common complex disorder // European Journal of Obstetrics Gynecology and Reproductive Biology (2015), 185, pp. 59-65.
  5. Vladislav S. Baranov, Tatyana E. Ivaschenko. Maria I. Yarmolinskaya Systems genetics view of endometriosis and leiomyoma. Two sides of the same coin? Systems Biology in Reproductive Medicine UAAN-2015-0119.R2.

Наиболее важные публикации за последние 5 лет

  1. Современные алгоритмы и новые возможности пренатальной диагностики наследственных и врожденных заболеваний: Методические рекомендации / Баранов В.С., Кузнецова Т.В., Кащеева Т.К. и др.; Под ред. В.С.Баранова и Э.К.Айламазяна. – СПб.: Изд-во Н-Л, 2013. – 150 с.
  2. Пренатальная диагностика / Баранов В.С., Кузнецова Т.В., Иващенко Т.Э., Кащеева Т.К., Коротеев А.Л., Кречмар М.В. /В кн. МЕДИЦИНСКАЯ ЛАБОРАТОРНАЯ ДИАГНОСТИКА: программы и алгоритмы: руководство для врачей / под ред. А.И. Карпищенко. – 3-е изд. перераб. и доп. – М. ГЭОТАР-Медиа, 2014. – С. 308-346.
  3. Glotov, A.S., Kazakov, S.V., Zhukova, E.A., Alexandrov, A.V., Glotov, O.S., Pakin, V.S., Danilova, M.M., Poliakova, I.V., Niyazova, S.S., Chakova, N.N., Komissarova, S.M., Kurnikova, E.A., Sarana, A.M., Sherbak, S.G., Sergushichev, A.A., Shalyto, A.A., Baranov, V.S. Targeted next-generation sequencing (NGS) of nine candidate genes with custom AmpliSeq in patients and a cardiomyopathy risk group // Clinica Chimica Acta (2015), 446, pp. 132-140.
  4. Efimova OA, Pendina AA, Tikhonov AV, Fedorova ID, Krapivin MI, Chiryaeva OG, Shilnikova EM, Bogdanova MA, Kogan IY, Kuznetzova TV, Gzgzyan AM, Ailamazyan EK, Baranov VS. Chromosome hydroxymethylation patterns in human zygotes and cleavage-stage embryos. // Reproduction. 2015; 149 (3): 223-233.
  5. Baranov V., Ivashchenko T., Yarmolinskaya M. Comparative system genetics of endometriosis and uterine leiomyoma. Two sides of the same coin. Syst Biol Reprod Med 2016; 62:93–105.

Патенты

  1. Пат. №2431842 Российская Федерация, МПК G01N33/53. Способ прогнозирования риска развития гестоза на основе генетических маркеров[Текст] / Глотов А.С., Вашукова Е.С., Бикмуллина Д.Р., Зайнуллина М.С., Баранов В.С., Айламазян Э.К; заявитель и патентообладатель Учреждение Российской Академии Медицинских Наук Научно-исследовательский институт акушерства и гинекологии им. Д.О. Отта Северо-Западного отделения РАМН (НИИАГ им. Д.О. Отта СЗО РАМН) (RU). — №2010127026; заявл. 29.06.2010; опубл. 20.10.2011, Бюл. № 29. — 10 с. : ил.
  2. Пат. № 2408607 Российская Федерация, МПК C07K17/06 C07K17/08 A61K47/42. Способ направленной доставки ДНК в опухолевые и стволовые клетки [Текст] / Баранов В.С., Егорова А.А., Киселев А.В.; заявитель и патентообладатель ООО «ДжинАрт» (RU). — № 2408607; заявл. 25.12.2008; опубл. 10.01.2011, Бюл. № 1. — 14 с. : ил.
  3. Махрова И.А., Глотов О.С., Глотов А.С. Способ оценки риска развития метаболического синдрома у детей на основе генетических и биохимических маркеров. Патентная заявка №2012108059/15(012159) от 27.02.2012. Патент №2492485 от 10.09.2013.
  4. Егорова А.А., Богачева М.С., Шубина А.Н., Баранов В.С., Киселев А.В. Носитель для направленной доставки нуклеиновых кислот в клетки, экспрессирующие рецептор CXCR4 // Заявка на изобретение №2012158198, приоритет от 21.12.2012.

Гранты

  1. №16.512.11.2035 Государственный контракт на выполнение научно-исследовательских работ от 11.02.2011г. Руководитель – В.С.Баранов. «Исследование генетических маркеров, определяющих фенотипические (рост, вес, ИМТ, ОТ/ОБ) и биохимические (спектр липидов) признаки человека, с целью разработки наборов реагентов для идентификации личности».
  2. №1.38.79.2012 Проект ИАС «Исследование молекулярно-генетических маркеров здоровья студентов СпбГУ, с учетом спортивных занятий и физкультуры». 2012г.
  3. №008-2/53/2013 контракт на СЧ НИР шифр «Посейдон-А» /2от «14» мая 2013г. «Разработка методов генетического типирования биоматериала человека.
  4. №6700р/9639 Фонд Содействия МП НТС. «Разработка трансфекционного агента для доставки нуклеиновых кислот».
  5. №10-04-01236-а. РФФИ «Невирусные носители для адресной доставки ДНК в стволовые клетки с целью генно-клеточной терапии мышечной дистрофии Дюшенна». 2010-2011 гг.
  6. №8142. ФЦП «Научные и научно-педагогические кадры инновационной России» «Разработка подходов к генной терапии эндометриоза, направленных на подавление ангиогенеза с помощью интерферирующих РНК». 2012-2013 гг.
  7. №14-15-00737 РНФ Исследование молекулярно-генетических, эпигенетических и цитогенетических особенностей функции генома клеток миометрия и эндометрия матки в норме и патологии. 2014-2016 гг.
  8. №16-94-1138 РФФИ Специфичность паттернов 5-гидроксиметилцитозина в геноме клеток эмбриональных и экстраэмбриональных тканей человека при нормальном развитии и эмбриональных потерях. 2014-2016.

Уникальное оборудование

  1. Секвенатор первичной структуры ДНК/РНК – PGM Ion Torrent (Life technjlogy).
  2. Генетический анализатор (секвенатор) АВI 3130 XL.
  3. Прибор для сравнительной геномной гибридизации – сканер для микрочипов Scan RI.
  4. Приборы для ПЦР в реальном времени Applied Biosystems 7500.
  5. Rotor-Gene 4-х канальный.
  6. Амплификаторы Applied Biosystems 2720.
  7. прибор для эмульсионной ПЦР Onetouch.

Международные научные проекты

№11025р/20250. Фонд Содействия МП НТС российско-германский проект «Разработка средств эффективной и специфичной трансфекции клеток в сочетании с магнитофекцией». 2012-2014 гг.

Лаборатория участвует в программах контроля качества ФСВОК (РФ) с 2005 года (по разделам «Пренатальный скрининг 1 триместра», «Пренатальный скрининг 2 триместра» и «Клиническая цитогенетика», лаб.№ 07380), с 2010 – в Maternal screening programme of Randox International Quality Assessment Scheme - RIQAS (UK)