Основной задачей Института является научно-исследовательская деятельность по следующим направлениям: экология и репродуктивная функция женщин; физиология и патология эмбриогенеза, перинатология; охрана здоровья женщины вне беременности (регуляция фертильности); охрана здоровья женщины во время беременности, родов и послеродового периода; эндокринология репродукции.
В Институте проводятся заседания Общества акушеров-гинекологов Санкт-Петербурга и Северо-западного региона, а также конгрессы, конференции и симпозиумы с участием видных отечественных и зарубежных специалистов, телемосты. В 2011 году проведен 1-й Национальный конгресс «Дискуссионные вопросы современного акушерства».
Институт участвует в ряде международных проектов, является сотрудничающим Центром ВОЗ по контролю качества гормональных исследований. За успехи в этой области Институт отмечен специальным сертификатом ВОЗ (1992 г.).