+7(812)679-55-51(многоканальный)
ВЕРСИЯ ДЛЯ СЛАБОВИДЯЩИХВакансииКонтакты
Знак Трудового ордена красного знамени
Запись на прием
Научно-исследовательский институт акушерства, гинекологии и репродуктологии им. Д.О. ОттаНаучно-исследовательский институт акушерства, гинекологии и репродуктологииим. Д.О. Отта

Наука

Структура научных подразделений

ФГБНУ "НИИ АГиР им. Д.О. Отта" проводит фундаментальные, поисковые и прикладные (в т.ч. клинических) научных исследований по следующим направлениям:

  • патология беременности, родов и послеродового периода;
  • перинатология;
  • репродукция человека;
  • охрана здоровья женщин.
  • Отдел акушерства и перинатологии

    В состав Отдела репродуктологии входит Группа перинатальных технологий.

    Отделение патологии беременности является старейшим клиническим отделением института, в котором проводятся научные исследования, фундаментальность которых определяется их медико-биологической и социальной значимостью, а также имеет большое практическое внедрение.

    Основные направления исследований

    • Беременность и роды при различной соматической патологии (сахарный диабет, бронхиальная астма, артериальная гипертензия и др.).
    • Невынашивание беременности (преждевременные роды).
    • Гестоз (эклампсия, преэклампсия).
    • Хроническая плацентарная недостаточность.

    Наиболее значимые результаты для науки и практики

    Детально исследованы патогенетические механизмы развития неблагоприятных перинатальных осложнений при различных состояниях: преждевременные роды, гестоз, хроническая плацентарная недостаточность, беременность при экстрагенитальных заболеваниях, после применения ВРТ. Создан дифференцированный подход к диагностике, оптимальной терапии и профилактике данных осложнений.

    Перспективы научных исследований

    • Выявление новых маркеров и предикторов в патогенезе развития наиболее значимых неблагоприятных перинатальных осложнений: преждевременные роды, гестоз, хроническая плацентарная недостаточность, беременность при сахарном диабете.
    • Разработка и внедрение новых алгоритмов к диагностике, терапии и профилактике привычного невынашивания беременности, АФС.

    Основные научные работы

    1. Применение препаратов магния при различных формах гестоза. Лечение. Профилактика: методические рекомендации/Кошелева Н.Г., Аржанова О.Н., Комаров Е.К., Ковалева Т.Г., Никологорская Е.В., назарова С.И.; ред. Э.К.Айламазян, Н.Г.Кошелева. - М.: Алекспринт, 2012. - 28 с.
    2. Оценка концентрации эндотелина-1 и sICAM-1 в плазме крови у беременных с гестационным сахарным диабетом /Капустин Р.В., Аржанова О.Н., Соколов Д.И., Чепанов С.В., Сельков С.А. // Акушерство и гинекология. - 2013. - N 5. - С.36-41.
    3. Плацента женщин в норме и при бронхиальной астме различной степени тяжести (иммуногистохимическое и гистологическое исследование) /Зубжицкая Л.Б., Шаповалова Е.А., Лаврова О.В., Дымарская Ю.Р., Аржанова О.Н.  // Морфология. - 2014. - N 2. -  С.46-52.
    4. Антифосфолипидный синдром при невынашивании беременности /Шляхтенко Т.Н., Алябьева Е.А., Аржанова О.Н., Сельков С.А., Плужникова Т.А.,  Черепанов С.В.  // Журнал акушерства и женских болезней. - 2015. - Т.LXIV,N 5. - С.69-76 .
    5. Иммуноморфология плаценты при гестозах и экстрагенитальной патологии / Зубжицкая Л.Б., Кошелева Н.Г., Семенов В.В., Шаповалова Е.А., Пюрбеева Е.Н., назарова С.И., Аржанова О.Н., Лаврова О.В. // Айламазян Э.К. Функциональная морфология плаценты человека в норме и при патологии (нейроиммуноэндокринологические аспекты /Айламазян Э.К., Полякова В.О., Кветной И.М. — СПб.: Изд—во Н-Л., 2012. — С.150-164.

    Гранты

    Грант РФ 14-15-00737 «Исследование молекулярно-генетических, эпигенетических и цитогенетических особенностей функции генома клеток миометрия и эндометрия матки в норме и патологии».

    Патенты

    Жесткова Н.В. «Способ определения мозговой изоформы креатинфосфокиназы в крови человека». Заявка от 5.06.16 №2015124963/15.

    Научные школы

    • иммунология репродукции;
    • молодежное научное общество акушеров и гинекологов;
    • общество по невынашиванию беременности;
    • общество по гестозам;
    • сертификационные курсы по современным вопросам акушерства, гинекологии и репродукции.
  • Отдел гинекологии и эндокринологии

    В состав Отдела репродуктологии входит Лаборатория эндокринологии.

    Основные направления исследований

    • Изучение влияния эндокринных заболеваний на репродуктивную систему женщины: болезни щитовидной железы, сахарный диабет.
    • Изучение механизмов развития и разработка способов лечения недостаточности яичников и гормонального бесплодия.

    Наиболее значимые результаты для науки и практики

    Выяснение роли тиреостимулирущей активности крови в развитии диффузного токсического зоба и разработка метода радиойодтерапии тиреотоксикоза низкими дозами I¹³¹ в сочетании с поддерживающими дозами антитиреоидных препаратов.

    Определение роли регуляторных нарушений и первичноовариальных факторов в развитии недостаточности яичников. Разработанный алгоритм диагностики овариальной недостаточности позволяет применять оптимальные методы индукции овуляции и преодоления бесплодия.

    Перспективы научных исследований

    • Разработка эффективных методов терапии эндокринных заболеваний вне и во время беременности позволит существенно снизить акушерские осложнения и неонатальную заболеваемость.
    • Изучение центральных звеньев патогенеза недостаточности яичников будет способствовать повышению эффективности лечения гормонального бесплодия.

    Основные научные работы

    1. Эффективность различных режимов инсулинотерапии у больных с сахарным диабетом 1-го типа во время беременности/ Потин В.В., Боровик Н.В., Тиселько А.В.//Журнал акушерства и женских болезней. - 2013. - Т. LXII. № 3. С. 77-82.
    2. Влияние диффузного токсического зоба на течение и исход беременности/Ловкова Ю.С., Потин В.В., Ткаченко Н.Н., Шелаева Е.В., Мусаева Т.Т.//Журнал акушерства и женских болезней. -2012. - Т. LXI. № 4. С. 67-74.
    3. Аллельные варианты гена cyp 19 (ароматазы р450) и активность ароматазы р450 у больных с синдромом поликистозных яичников/Савина В.А., Швед Н.Ю., Потин В.В., Тарасова М.А., Ярмолинская М.И., Иващенко Т.Э., Баранов В.С.// Медицинская генетика. -2012. - Т. 11. № 4 (118). С. 36-41.
    4. Роль овариальной ароматазы р450 в патогенезе нормогонадотропной ановуляции/Савина В.А., Потин В.В., Рулев В.В.//Журнал акушерства и женских болезней. -2011. - Т. LX. № S. С. 81.
    5. Диагностика и лечение неклассической формы врожденной гиперплазии коры надпочечников/Айламазян Э.К., Соболева Е.Л., Потин В.В., Осиновская Н.С.//Журнал акушерства и женских болезней. -2011. -Т. LX. № 1. С. 88-96.
    6. Сахарный диабет и репродуктивная системы женщины : руководство для врачей / под ред. Э.К. Айламазяна. - М.: ГЭОТАР-Медиа, 2017. - 432 с, : ил.

    Патенты

    1. Способ оценки ароматазной активности (RU 2481587), Заявка N 2013147216 от 21.02.2012, зарегистрирован 10.05.2013.
    2. Способ оценки овариальной ароматазной активности (RU 2549491), Заявка N 2013147216 от 22.10.2013, зарегистрирован 30.03.2015.

    Уникальное оборудование

    В отделе имеется гормональная лаборатория, оснащённая современным оборудованием для определения гормонов в биологических жидкостях иммуноферментными методами.

    Международные научные проекты

    «Сравнение эффективности и безопасности инсулина деглудек/Лираглутид и инсулина глоргин у пациентов с сахарным диабетом 2 типа» (совместно с Дания, НовоНордиск, NN 9068-3952).

    Подготовлено более 60 кандидатов и докторов медицинских наук, работающих в области гинекологической эндокринологии.

  • Отдел репродуктологии

    В состав Отдела репродуктологии входит Лаборатория раннего эмбриогенеза.

    Основные направления исследований

    1. Разработка эффективных методов лечения бесплодия у пациентов с гормональной недостаточностью яичников методами ВРТ.
    2. Определение молекулярно-биологических показателей оценки качества ооцитов, сперматозоидов и эмбрионов, определяющих перспективы наступления беременности в программах ЭКО.
    3. Исследование имплантационной способности эндометрия в программах ЭКО. Разработка методов эффективной коррекции нарушения рецептивности эндометрия у больных с бесплодием и привычным невынашиванием беременности.

    Наиболее значимые результаты для науки и практики

    За последние годы научные сотрудники отделения ВРТ провели ряд инновационных исследований, результаты которых доложены на многих международных и всероссийских научных конференциях и конгрессах, а практические рекомендации нашли своё применение в повседневной клинической практике отделения.

    Проведен сравнительный анализ эффективности стимуляции яичников, качества эмбрионов в протоколах ЭКО у больных с наружным генитальным эндометриозом после хирургического лечения эндометриом яичников и гомональной терапии диеногестом, агонистами ГнРГ и без гормонального лечения. Доказано, что назначение диеногеста перед протоколом ЭКО больным, прооперированным по поводу эндометриом яичников, приводит к достоверному увеличению частоты беременности и родов по сравнению с аналогичными показателями у больных без гормонального лечения.

    Изучение эффективности лечения бесплодия методами ЭКО у больных с трубно-перитонеальным фактором бесплодия, вследствие перенесенной хламидийной инфекции показало снижение результативности протоколов ЭКО (частоты клинической беременности и родов), а также увеличение риска недостаточного ответа яичников на гонадотропную стимуляцию и частоты неразвивающейся беременности в циклах ЭКО (ЭКО/ICSI). Разработан метод прогноза эффективности цикла ЭКО (ЭКО/ICSI). На основании анализа крови на наличие антихламидийных антител можно предугадать "бедный" ответ яичников (менее 3 фолликулов) на стимуляцию и оценить риск неразвивающейся беременности после ЭКО (ЭКО/ICSI).

    Предложен новый диагностический тест – TUNEL (Terminal deoxynucleotidyl transferase dUTP Nick End Labeling), позволяющий оценить долю сперматозоидов с фрагментированной ДНК в эякуляте пациентов. Данный метод оценки повреждения ДНК сперматозоидов является одним из наиболее эффективных и прогностически значимых: позволяет выявить возможную причину снижения эффективности оплодотворения, нарушения развития эмбрионов, а также прерывания беременности.

    При внутрицитоплазматической инъекции сперматозоида в ооцит возможно применение двунаправленной селекции сперматозоидов. Метод ИМСИ (инъекция сперматозоида после морфологической селекции) позволяет отобрать сперматозоиды с наилучшей морфологией, а использование гиалуроновой кислоты даёт возможность выбрать зрелые сперматозоиды. Такой метод повышает эффективность оплодотворения и вероятность развития нормальных эмбрионов.

    Впервые представлена многофакторная оценка рецептивности эндометрия в цикле стимуляции суперовуляции с использованием допплерометрических показателей кровотока в сосудах матки, уровня экспрессии цитокинов и факторов роста в цервикальной слизи и тканевых структурах эндометрия. Предложены неинвазивные методы оценки маркеров, определяющих рецептивность эндометрия в циклах ЭКО. По разработанной методике получен патент РФ на изобретение (№ 2562559). Результаты внедрены в клиническую практику отделения.

    В ходе выполнения НИР по гранту Минобрнауки РФ разработана экспериментальная модель хронического эндометрита. Был проведён выбор клеточного продукта на основе эндометриальных стволовых клеток (ЭСК), изучена эффективность лечебного эффекта клеточной терапии, в зависимости от пути введения. Установлена возможность восстановления нормального морфологического строения эндометрия после его повреждения при использовании клеточной терапии в эксперименте. Получен патент РФ на изобретение (№ 2533739).

    Перспективы научных исследований

    • Выделить наиболее значимые молекулярные характеристики ооцит-кумулюсных комплексов в фолликулярной жидкости, определяющие развитие морфологически качественных эмбрионов с наилучшим имплантационным потенциалом.
    • Провести преимплантационную генетическую диагностику эмбрионов с известными молекулярными характеристиками ооцит-кумулюсных комплексов.
    • Верификация значимых молекулярных характеристик протеомики и метаболомики делящихся эмбрионов в образцах культуральной среды.
    • Создать математическую модель и разработать алгоритм диагностики функционального состояния ооцитов и развивающихся эмбрионов.

    Основные научные работы

    1. Айламазян Э.К., Гзгзян А.М., Савинов П.А., Ниаури Д.А., Джемлиханова Л.Х., Усольцева Е.О., Радькова Ю.В., Савельев А.В. Особенности реакции импланта аутологичного эндометрия на механическое воздействие в эксперименте // Журнал акушерства и женских болезней. 2012. Т. LXI. № 3. С. 22-30.
    2. Крылова Ю.С., Шарфи Ю.Н., Гзгзян А.М., Соснина А.К., Кветной И.М. Иммуногистохимические критерии имплантационной восприимчивости эндометрия // Молекулярная медицина. 2014. № 5. С. 24-28.
    3. Коган И.Ю., Геркулов Д.А., Гзгзян А.М. Консервативные тенденции в стратегии преодоления бесплодия у пациенток с генитальным эндометриозом. Эффективная фармакотерапия. 2015. № 19. С. 16-22.
    4. Efimova O.A., Pendina A.A., Tikhonov A.V., Fedorova I.D., Krapivin M.I., Chiryaeva O.G., Shilnikova E.M., Bogdanova M.A., Kogan I.Y., Kuznetzova T.V., Gzgzyan A.M., Ailamazyan E.K., Baranov V.S. // Reproduction. 2015. 149(3) р.223-233.
    5. Sharfi Y., Dzemlikhanova L., Niauri D., Shilnicova E., Fedorova I., Krikhely I., Gzgzyan A. // Endometrial receptivity evaluation in IVF cycles. Gynecological endocrinology. - 2015. –Vol.31 (S1). - P. 74-78.
    6. Muller V., Savicheva A., Kogan I.Y., Shalepo K., Fedorova I., Lesik E., Shilnikova E., Bogdanova M., Gzgzyan A. Association between anti-chlamydial immunity and IVF outcome // Gynecological endocrinology. - 2015. – Vol.31 (S1). -P. 69-73.

    Патенты

    1. Способ моделирования хронических воспалительных заболеваний женских половых органов в эксперименте №2533739 от 23.09.2014 г. Айламазян Э.К., Ниаури Д.А., Гзгзян А.М., Джемлиханова Л.Х., Радькова Ю.А., Савельев А.Н., Усольцева Е.О.
    2. Способ прогнозирования рецептивности эндометрия в циклах экстракорпорального оплодотворения № 2562559 от 10.09.2015г. Айламазян Э.К., Ниаури Д.А., Джемлиханова Л.Х., Коган И.Ю., Гзгзян А.М., Шарфи Ю.Н.

    Гранты

    Минобрнауки ГК № 16.512.11.2190 от 14.03.2011. «Разработка модели заболеваний эндометрия и коррекция заболеваний с помощью клеточного продукта на базе стволовых эндометриальных клеток».

    Уникальное оборудование

    1. Станции IVF c ламинарным потоком 1 и 2 класса защиты, встроенным стереомикроскопом для стандартной эмбриологической работы на трансвагинальной пункции ооцитов, биопсии яичка и работы с эмбрионами и гаметами.
    2. Устройство для сухой дезинфекции ультразвуковых датчиков Antigermicx S1, позволяющее проводить инвазивные процедуры с использованием трансвагинальных датчиков у пациентов с гемоконтактными инфекциями (ВИЧ, гепатиты В и С).
    3. Инвертированный микроскоп Leica DMI 3000B c набором объективов и системой видеорегистрации для проведения внутрицитоплазматической инъекции сперматозоида в ооцит, а также морфологической селекции сперматозоидов (ИМСИ).
    4. Инвертированный микроскоп Nikon c набором объективов, системой лазерной диссекции Octax и системой видеорегистрации для получения материала (биопсии бластомеров и трофэктодермы) для проведения доимплантационной диагностики.
    5. Система криохранилища и сосуды Дьюара Taylor-Wharton для длительного хранения биологического материала (эмбрионов и гамет).
    6. Программируемая система TermоBride StatSpin и флуорпесцентный микроскоп Leica c набором объективов и фильтров для проведения многоцветной гибридизации in situ при выполнении доимплантационной диагностики.

    Международные научные проекты

    1. Рандомизированное, контролируемое, слепое для лиц, проводивших оценку, проводимое в параллельных группах, многоцентровое, международное исследование сравнения эффективности и безопасности препарата FE 999049 с фоллитропином- альфа (Gonal-F) при контролируемой стимуляции яичников у женщин, участвующих в программе с применением вспомогательной репродуктивной технологии. Партнёр проекта: ООО "Инвентив Хелс Клиникал".
    2. Контролируемое, слепое для лиц, проводящих оценку, проводимое в параллельных группах, многоцентровое, международное исследование иммуногенности препарата FE 999049 в повторных циклах контролируемой стимуляции яичников у женщин, участвующих в программе с применением вспомогательной репродуктивной технологии. Партнёр проекта: ООО "Инвентив Хелс Клиникал".
  • Отдел иммунологии и межклеточных взаимодействий

    В состав Отдела иммунологии и межклеточных взаимодействий входят:

    • Лаборатория межклеточных взаимодействий;
    • Группа протеомной иммунорегуляции.

    Наиболее значимым практическим направлением работы Отдела является обследование супружеских пар с неяснями механизмами бесплодия, неудачами ЭКО и невынашивания беременности. Кроме того, в Отделе проводится оценка факторов противовирусного и противобактерийного иммунитета у пациентов с рецидивирующими и устойчивыми к терапии хроническими инфекционно воспалительными процессами. По результатам обследований пациенты могут получить рекомендации по терапии у иммунологов врачей высшей категории: з.д.н. РФ профессора Селькова Сергея Алексеевича и к.м.н. Шляхтенко Татьяны Николаевны.

    В 2015 г. в состав отдела иммунологии и межклеточных взаимодействий была включена группа сотрудников лаборатории биохимии, которая на протяжении 1990 – 2015 г. г. под руководством з.д.н. РФ, профессора Арутюняна А.В. занималась изучением механизмов гипоталамической регуляции репродуктивной функции, и экспериментальному исследованию хронобиологических аспектов влияния неблагоприятных экологических факторов, обладающих нейротоксическим действием, на овариальные циклы. Показано, что нейротоксическое воздействие пренатальной гипергомоцистеинемии вызывает нарушение репродуктивной и когнитивной функций у потомства. Важным направлением исследований лаборатории являлось изучение роли окислительного стресса в плаценте как патогенетического фактора развития различных осложнений беременности (невынашивание, гестоз), а также разработка нейрохимических критериев нарушений развития ЦНС новорожденного при внутриутробной гипоксии. Биохимические исследования, проводимые в настоящее время в отделе иммунологии и межклеточных взаимодействий, связаны с изучением биохимических аспектов взаимодействия клеток иммунной системы между собой, с клетками трофобласта и эндотелиальными клетками, что представляет большой интерес с точки зрения репродуктивной медицины. В частности, с использованием самой современной аппаратуры оценивается белковый спектр клеток и их производных-микрочастиц.

    В настоящее время в Отделе работают 5 докторов и 6 кандидатов наук, 2 профессора, 2 заслуженных деятеля науки РФ, 3 врача-лаборанта высшей категории, 2 врача иммунолога высшей категории.

    Основные направления исследований

    • Изучение особенностей состояния иммунной системы беременности, а также при различных формах акушерской и гинекологической патологии.
    • Оценка факторов иммунитета при различных иммунодефицитных состояниях и рецидивирующих инфекциях.
    • Разработка и назначение методов иммунокоррегирующей терапии при различных формах акушерской и гинекологической патологии, иммунодефицитных состояниях.
    • Изучение ангиогенеза и влияния на этот процесс клеток иммунной системы.
    • Изучение взаимодействия клеток трофобласта и клеток иммунной системы.
    • Изучение везикулярных микрочастиц клеточного происхождения как новых субъектов межклеточной сигнализации.
    • Изучение роли макрофагов и естественных киллеров в развитии плаценты.

    Наиболее значимые результаты для науки и практики

    В отделе иммунологии и межклеточных взаимодействий получены приоритетные данные, вносящие важный вклад в фундаментальные разделы репродукции.

    Впервые дана комплексная оценка механизмов ангиогенеза плаценты и факторов, влияющих на развитие её сосудистой сети при различных формах акушерской патологии.

    Получены приоритетные данные, касающиеся роли плацентарных макрофагов при физиологической беременности и её нарушениях.

    Впервые получены данные, касающиеся механизмов формирования микрочастиц клеточного происхождения и выдвинуты предположения об их роли в межклеточных взаимодействиях и формировании иммунологической толерантности при беременности.

    Приоритетные фундаментальные научные исследования позволили разработать и внедрить новые методы диагностики и терапии целого ряда акушерско-гинекологических патологий и иммунологических исследований. В клиническую практику внедрены принципы и методы диагностики и иммуномодулирующей терапии наружного генитального эндометриоза, бесплодия, невынашивания беременности, преэклампсии.

    Обосновано использование биосовместимых мембран, обеспечивающих оптимальные репаративные процессы после операции кесарева сечения, позволяющие при последующих беременностях заканчивать роды естественным путём.

    Перспективы научных исследований

    • Создание моделей для оценки влияния цитокинов и факторов, секретируемых плацентой, на особенности взаимодействия клеток, участвующих в формировании и развитии плаценты, процессов ангиогенеза как со стороны плода, так и со стороны матери.
    • Разработка новых методов диагностики и мониторирования эффективности лечения акушерских патологий и патологий женской репродуктивной сферы.
    • Изучение возможности применения везикулярных микрочастиц клеточного происхождения для терапевтического применения.

    Потребителями результатов могут быть научно-исследовательские институты, лаборатории и группы, интересы которых связаны с изучением проблем преодоления бесплодия, привычного невынашивания беременности и недостаточности функции плаценты, преэклампсии, эндометриоза. Разрабатываемые в лаборатории методы также могут быть использованы фармацевтическими компаниями, специализирующимися на разработке препаратов, влияющих на ангиогенез и клетки иммунной системы. На основе полученных результатов планируются перспективные научно-исследовательские работы в области ЭКО, направленных на разработку методов коррекции нарушений процесса имплантации, а также создание научно-практических рекомендаций для врачей-клиницистов.

    Основные научные работы

    1. Sokolov DI, Furaeva KN, Stepanova OI, Ovchinnikova OM, Viazmina LP, Kozonov GR, Kuzminykh TU and Selkov SA. Changes in Functional Activity of JEG-3 Trophoblast Cell Line in the Presence of Factors Secreted by Placenta. Archives of medical research. 2015;46(4):245-56.
    2. Sokolov DI, Ovchinnikova OM, Korenkov DA, Viknyanschuk AN, Benken KA, Onokhin KV and Selkov SA. Influence of peripheral blood microparticles of pregnant women with preeclampsia on the phenotype of monocytes. Translational research: the journal of laboratory and clinical medicine. 2014. DOI: 10.1016/j.trsl.2014.11.009.
    3. Arutjunyan A., Kozina L., Stvolinskiy, Buligina Y., Mashkina A., Khavinson V. Pinealon protects the rat offspring from prenatal hyperhomocysteinemia// Int. J. Clin. Exp. Gerontol. 2012. V.5 (2). P.179 – 185.
    4. Korenevsky A., Milyutina Yu., Kozina L., Kerkeshko G., Arutjunyan A.. Role of reactive oxygen species in ppremature ageing of female reproductive function. Current Aging Science. 2017. V.10 (1). Р. 26 – 32. Special Issue (ed. by Alexander Arutjunyan)
    5. Onokhina Y.S., L'Vova T Y., Tsitskarava D.Z., Koren'kov D.A., Sel'kov S.A., Sokolov D.I. Effect of factors produced by the placenta on cytokine secretion by THP-1 cells cultured on a 3D scaffold. Bull Exp Biol Med. 2014; 156 (4): 566-70.
    6. Lvova T.Y., Stepanova O.I., Furaeva K.N., Korenkov D.A., Sokolov D.I., Selkov S.A. Effects of placental tissue secretory products on the formation of vascular tubules by EA.Hy926 endothelial cells. Bull Exp Biol Med. 2013; 155 (1): 108-12.
    7. Mikhaylova V.A., Onokhina Y.C., Ovchinnikova O.M., Maksimova I.M., Arzhanova O.N., Sokolov D.I., et al. Phenotypical characteristics of peripheral blood monocytes in normal pregnancy and gestosis. Bull Exp Biol Med. 2013; 154 (4): 471-5.
    8. Pavlov, O.V., et al., Coordinated expression of TNFalpha- and VEGF-mediated signaling components by placental macrophages in early and late pregnancy. Placenta, 2016. 42: p. 28-36.
    9. Selkov, S.A., et al., Comparative phenotypic characterization of human cord blood monocytes and placental macrophages at term. Placenta, 2013. 34(9): p. 836-9.
    10. Pavlov, O.V., et al., IL-11 Expression in Human Term Placental Macrophages. American Journal of Reproductive Immunology, 2010, P.397-402.
    11. Pavlov, O.V., et al., Characterization of Cytokine production by Human Term Placenta Macrophages in Vitro American Journal of Reproductive Immunology, №60, 2008, P.556-567.

    Монографии

    1. Сельков С.А., Павлов О.В. Плацентарные макрофаги.- М., «Товарищество научных изданий КМК», 2007.- 187 с.
    2. А.В. Арутюнян, А.В. Шестопалов, И.О. Буштырева, З.И. Микашинович. Биохимические механизмы формирования плаценты при физиологической и осложненной беременности (под ред. академика РАМН Э.К. Айламазяна). С.Пб. 2010. – 188 с.
    3. Соколов Д.И., Сельков С.А. Иммунологический контроль формирования сосудистой сети плаценты. –СПб.: Издательство Н-Л, 2012. -208с.

    Патенты

    • Патент № 2548754 от 24.03.2015 «Способ прогнозирования цитопротективного эффекта иммуноглобулинов для внутревенного введения при терапии женщин с привычным невынашиванием беременности и диагностированным антифосфолипидным синдромом» Чепанов С.В., Соколов Д.И., Шляхтенко Т.Н., Зайнулина М.С., Мирашвили М.И., Сельков С.А.
    • Решение о выдаче патента: «Способ формирования рубца на матке после кесарева сечения». Айламазян. Э.К., Андреева В.Ю., Кузьминых Т.У., Сельков С.А., Павлова Н.Г., Нестеренко В.Г., Нестеренок С.В., Суслов А.П., Сафорян А.А., Калмыклва Н.В. Получено решение о выдаче патента по заявке №2013149433/14(076945) Патентообладатель: ФГБНУ «НИИ АГиР им.Д.О.Отта». Дата приоритета 06.11.2013.

    Гранты

    1. Государственные контракты: ГК№ 02.740.11.0711, заказчик Министерство образования и науки Российской Федерации, срок выполнения 2010-2012, руководитель академик РАМН Айламазян Э.К.
    2. Грант Президента Российской Федерации для государственной поддержки молодых российских ученых докторов наук МД-150.2011.7, срок выполнения 2011-2012гг, руководитель д.б.н. Соколов Д.И.
    3. Грант РФФИ 13-04-00304, срок выполнения 2013-2015, руководитель д.б.н. Соколов Д.И.
    4. Грант правительства Санкт-Петербурга на предоставление субсидий молодым ученым, молодым кандидатам наук вузов, отраслевых и академических институтов, расположенных на территории Санкт-Петербурга. Тема: «Эндотелиопротективный эффект иммуноглобулинов для внутривенного введения», срок выполнения 2015, руководитель Чепанов С.В.
    5. Грант правительства для студентов вузов, расположенных на территории Санкт-Петербурга (2014 год). Тема: «Особенности функциональных свойств клеток трофобласта при беременности».
    6. Грант РФФИ 13-04-0030413, тема «Роль плацентарных факторов в изменении функциональных характеристик моноцитов\макрофагов.» источник финансирования Министерство образования и науки.
    7. Грант Президента Российской Федерации для государственной поддержки молодых ученых – кандидатов наук 2013 года.
    8. Грант МД-150.2011.7 Президента Российской Федерации для государственной поддержки молодых ученых – докторов наук 2011 года, источник финансирования Министерство образования и науки.
    9. Грант для молодых ученых от Правительства Санкт-Петербурга.34 / 05 - 07 / 12-МУ «Влияние факторов, секретируемых тканью плаценты, на функциональное состояние эндотелиальных клеток линии EA.hy926».
    10. Грант РФФИ 10-04-749, срок выполнения 2010-2012, руководитель проф. Арутюнян А.В.
    11. Грант РФФИ 14-04-776, сроки выполнения 2014-2016, руководитель проф. Арутюнян А.В.

    Уникальное оборудование

    • Оборудование для проточной цитофлюорометрии (два проточных цитофлюориметра: FACSСanto II и FACScan (Becton Dickinson).
    • Сортировщик клеток FACSAria III (Becton Dickinson).
    • Система для прижизненного наблюдения за культивируемыми клетками - инвертированный микроскоп с СО2-инкубатором, оснащенный компьютерной системой анализа микроскопических изображений (AxioObxerver Z1, Zeiss, Германия).
    • Оборудование для работы с культурами клеток (ламинарные боксы, СО2-инкубаторы, морозильные и холодильные камеры, центрифуги, цифровые микропипетки-дозаторы, инвертированные микроскопы, люминисцентный микроскоп).
    • Оборудование для иммуноферментного анализа.
    • Оборудование для WesternBlot.
    • Оборудование общего назначения (вортексы, центрифуги, холодильники, термостаты, рН-метры, аналитические весы, компьютеры и другое сопутствующее оборудование).

    В лаборатории постоянно хранятся в криогенном хранилище и используются для проведения научных исследований следующие культуры клеток: трофобласт (BeWo, JEG3), эндотелиальные клетки линии EA.Hy926, NK-клетки (NK-92, NK-92mi), моноцитоподобные клетки линии THP-1, эритромиелоидные клетки линии K-562.

    Научные школы

    На базе лаборатории с 2006 года существует научная школа «Иммунология репродукции», в рамах которой выполняются исследования, поддержанные грантом Президента Российской Федерации по государственной поддержке ведущих научных школ Российской Федерации:

    • НШ-5268.2006.7, срок выполнения 2006-2007, руководитель академик РАН Айламазян Э.К.
    • НШ-1066.2008.7 срок выполнения 2008-2009, руководитель академик РАН Айламазян Э.К.
    • НШ-3594.2010.7,  срок выполнения 2010-2011, руководитель академик РАН Айламазян Э.К.
    • НШ-131.2012.7, срок выполнения 2012-2013, руководитель академик РАН Айламазян Э.К.
    • НШ-641.2014.7, срок выполнения 2014-2015, руководитель академик РАН Айламазян Э.К.
  • Отдел медицинской микробиологии

    В состав Отдела геномной медицины входит группа экспериментальной микробиологии.

    Основные направления исследований

    Инфекции репродуктивного тракта, урогенитальные и перинатальные инфекции, клиническая микробиология в акушерстве, гинекологии и неонатологии.

    Наиболее значимые результаты для науки и практики

    Решение проблем диагностики, профилактики и лечения репродуктивно значимых инфекций, изучение механизмов формирования и прогрессирования инфекционных заболеваний у матери, плода и новорожденного, организация диагностического процесса и внедрение стандартов качества диагностики урогенитальных, перинатальных и неонатальных инфекций, основанных на принципах доказательной медицины.

    Обоснованы новые подходы к диагностике, профилактике и лечению репродуктивно значимых инфекций у беременных, родильниц, новорожденных детей.

    Доказано клиническое значение факторов персистенции хламидий в этиологии трубноперитонеального бесплодия, показано значение бактериальных пленок, сформированных условно патогенными микроорганизмами, в развитии хронических заболеваний женских половых органов, внедрены в практическое здравоохранение меры профилактики перинатальной инфекции, вызванной  стрептококками группы В.

    Исследования в области инфекций, составляющих TORCH-синдром у новорожденных позволили снизить частоту прерываний беременности, заболеваемости и смертности новорожденных.

    Впервые в стране проведены исследования по выявлению молекулярных маркеров онкогенной активности вируса папилломы человека в ранней диагностике рака шейки матки, дана оценка диагностической и прогностической значимости тестов отечественного производства для выявления и типирования ВПЧ высокого онкогенного риска.

    Перспективы научных исследований

    Исследования по изучению физиологического и патологического микробиоценоза урогенитального тракта беременных и небеременных женщин, проводимого в рамках важной медицинской и общебиологической концепции микробиома человека, приведут к снижению репродуктивных потерь, что улучшит демографическую ситуацию в стране. Изучение бактериальных биопленок, сформированных условно патогенными микроорганизмами, в том числе Atopobium vaginae и Gardnerella vaginalis, а также разными генотипами Gardnerella vaginalis, позволит усовершенствовать диагностику и терапию бактериального вагиноза, хронического эндометрита, сальпингита.Вследствие угрожающей ситуации устойчивости бактерий к антибактериальным препаратам будут проводиться исследования факторов резистентности микроорганизмов к антибиотикам и бактериофагам, а также по разработке инновационных подходов к диагностике, терапии и профилактике репродуктивно значимых инфекций. В результате проведенных исследований ожидается улучшение качества микробиологической диагностики репродуктивно значимых инфекций и разработка стандартов и алгоритмов профилактики и терапии урогенитальных и перинатальных инфекций. Это позволит оптимизировать скрининг перинатальных и репродуктивно значимых инфекций, что приведет к снижению заболеваемости и смертности беременных женщин и их новорожденных.

    Основные научные работы

    1. Руководство по лабораторной диагностике инфекций урогенитального тракта/ под ред. Домейки М., Савичевой А., Соколовского Е., Балларда Р., Унемо М.//Издательство Н-Л, 2012.- Санкт-Петербург.- 288 с.
    2. Савичева А.М. Методы диагностики генитальных инфекций / в кн.: Шейка матки, влагалище, вульва (физиология/патология/ кольпоскопия/эстетическая коррекция) под ред. С.И. Роговской, Е.В. Липовой. 831 с., StatusPraesens. 2014. с.128-164.
    3. Савичева А.М., Шипицына Е.В. Урогенитальные инфекции/ в кн. Медицинская лабораторная диагностика: программы и алгоритмы под ред. Профессора Карпищенко А.И. Руководство для врачей, 3 издание дополненное и переработанное. 692 с., Москва, Издательство «ГЭОТАР Медиа». 2014. с. 377-395.
    4. Клинические рекомендации по ведению больных с инфекциями, передаваемыми половым путем (ИППП)/ Соколовский Е.В., Лиознов Д.А., Корнеев И.А., Савичева А.М.; ред. Э.К.Айламазян. – СПб, 2014.- 120 с.
    5. Савичева А.М., Коган И.Ю., Мюллер В.С., Тапильская Н.И., Шипицына Е.В./ Хламидийная инфекция: репродуктивные потери, неудачи ЭКО// СПб, ООО «Свое издательство», 2015, 108 с.

    Гранты

    «Многоцентровое двойное слепое рандомизированное контролируемое исследование эффективности, безопасности и иммуногенности вакцины против вируса папилломы человека 16 и 18 типов у женщин старше 25 лет», Фармацевтическая компания GlaxoSmithKline Biologicals, Бельгия (Вавр), 2006-2015.

    Уникальное оборудование

    Для обнаружения возможных возбудителей генитальных и неонатальных инфекций, выявления иммунного ответа на инфекцию, мониторинга эффективности терапии используется комплекс методов лабораторной диагностики (микроскопических, культуральных, серологических, иммунофлюоресцентных, иммуноферментных, молекулярно-биологических).

    Внедрены современные автоматизированные комплексы диагностики урогенитальных и неонатальных инфекций.

    Одним из приоритетных направлений деятельности лаборатории микробиологии является молекулярная диагностика инфекционных заболеваний с применением самых передовых технологий.

    Молекулярно-биологические методы являются точными и быстрыми способами обнаружения ДНК/РНК микроорганизмов. Одна из модификаций полимеразной цепной реакции, а именно ПЦР с детекцией в режиме реального времени позволяет определять количество копий ДНК/РНК исследуемом клиническом материале. Лаборатория микробиологии располагает различными модификациями оборудования для ПЦР как отечественного, так и зарубежного производства.

    Лаборатория располагает автоматической высоко производительной системой NucliSENS easyMAG для выделения нуклеиновых кислот, обеспечивающей очень высокую степень очистки, что позволяет использовать полученные препараты ДНК/РНК как для клинических анализов, так и для научных исследований.

    К числу современных диагностических методов, которыми располагает лаборатория, относится также метод NASBA в реальном времени, обладающий уникальной способностью избирательно выявлять специфическую последовательность РНК в присутствии идентичной последовательности ДНК, что определяет основные области его применения: диагностика инфекций, вызываемых РНК-содержащими вирусами, изучение экспрессии бактериальных и вирусных генов, диагностика бактериальных инфекций, основанная на выявлении 16S рРНК.

    Передовым методом идентификации микроорганизмов в клинической микробиологии является MALDI-TOF масс-спектрометрия, осуществляемая на оборудовании фирмы Bruker (Германия), позволяющем выявлять более 5000 видов микробов, населяющих биотопы человека в норме и при патологических состояниях.

    Микробиологический анализатор BioMic V3 предназначен для автоматизации чтения и интерпретации биохимических тестов, определения чувствительности к антибактериальным препаратам, контроля качества тестов различных производителей.

    Для автоматизации серологических исследований методом ИФА на микропланшетах мы используем специализированную платформу Minilyser фирмы TECAN (США).

    Повышение качества окраски микроскопических препаратов достигается применением автоматической станции окрашивания SAKURA Tissue Tek DRS 2000.

    В арсенале диагностических средств лаборатории имеется также методика определения нуклеотидной последовательности (секвенирования) ДНК, которая позволяет проводить молекулярную характеристику новых штаммов бактерий и вирусов и незаменима при разрешение сомнительных случаев, когда идентификация микроорганизма другими методами затруднена. Секвенирование является эффективным инструментом изучения  распространения штаммов микроорганизмов в популяции и определения географического происхождения возбудителей инфекционных заболеваний.  Кроме того, с помощью секвенирования можно идентифицировать штаммы, выделенные от пациентов с неудачами терапии и изучать мутации, определяющие устойчивость микроорганизмов к лекарственным препаратам, а также и дифференцировать низко- и высоковирулентные штаммы микроорганизмов.

    Международные научные проекты

    «Многоцентровое исследование устойчивости Mycoplasma genitalium к антимикробным препаратам», Центр ВОЗ по гонорее и другим ИППП, университетский госпиталь Оребро (Швеция) (WHO Collaborating Centre for Gonorrhoea and other STIs, Örebro University Hospital), 2014-2015.

    Научные школы

    Создана научная школа по микробиологии репродукции, которой принадлежит лидирующее положение в науке в области клинической микробиологии, микробиологии репродукции и перинатологии.

  • Отдел геномной медицины

    В состав Отдела геномной медицины входят:

    Отдел геномной медицины был создан на базе лаборатории пренатальной диагностики наследственных и врожденных болезней в 2019 году, тогда как сам Лаборатория пренатальной диагностики была основана более 30 лет назад член-корреспондентом РАН, профессором, доктором медицинских наук, Барановым Владиславом Сергеевичем. С момента основания деятельность лаборатории была направлена на раннюю диагностику и профилактику наследственных болезней и врожденных пороков развития, на разработку и внедрение биохимических, цитогенетических и молекулярно-генетических методов исследования, на тестирование наследственной предрасположенности к мультифакторным болезням, на разработку научных основ генной терапии. Лаборатория по праву считается колыбелью пренатальной диагностики, родоначальником персонализированной предиктивной медицины и «Генетического паспорта», пионером генной терапии наследственных заболеваний.

    Сегодня основными задачами отдела геномной медицины являются:

    • проведение научно-исследовательской работы в соответствии с основными научными направлениями Института;
    • внедрение новых методов генетических исследований (NGS секвенирование, сравнительная геномная гибридизация, ПГС моногенных и хромосомных болезней, неивазивный пренатальный скрининг);
    • систематизация, длительное хранение и исследование различных образцов биологического материала на эпидемиологическом, геномном и протеомном уровнях с целью комплексного биомедицинского исследования этиологии, патогенеза и факторов риска развития различных осложнений беременности (гестоз, гестационный сахарный диабет, хроническая плацентарная недостаточность и т. д.), гинекологических заболеваний (наружный генитальный эндометриоз, миома матки и т.д.), репродуктивной патологии (бесплодие), диабета II типа, широкого спектра наследственной патологии (муковисцидоз, адреногенитальный синдром, спинальная мышечная атрофия) и других заболеваний;
    • разработка новых персонализированных подходов к диагностике, профилактике и лечению наследственных и многофакторных заболеваний;
    • создание биоинформатических решений для медицинской генетики.

    Лаборатория геномики с группой биоресурсных коллекций

    Основные направления исследований

    • Исследование эндометриоза и миомы матки с позиций трансляционной медицины
    • Поиск маркеров осложненного течения беременности (преэклампсия, преждевременные роды, гестационный сахарный диабет и др.)
    • Изучение геномных и транскриптомных факторов риска сахарного диабета 2 типа и осложненного течения патологии
    • Развитие и поддержание биоресурсных коллекций образцов моногенных и мультифакторных патологий
    • Разработка новых методов выявления наследственных патологий, в том числе с целью ПД и ПГТ-М
    • Неинвазивное пренатальное тестирование

    Наиболее значимые результаты для науки и практики

    • Разработаны и внедрены алгоритмы проведения биохимического пренатального скрининга, пренатальной диагностики наследственных заболеваний, преимплатационного генетического тестирования хромосомных аномалий и моногенных заболеваний, неинвазивного пренатального тестирования
    • Создано отделение биоресурсных коллекций с уникальной научной установкой для обеспечения систематизации, длительного хранения и изучения образцов биологического материала с целью комплексного биомедицинского исследования этиологии и патогенеза различных осложнений беременности (преэклампсия, гестационный сахарный диабет, хроническая плацентарная недостаточность и т.д.), гинекологических заболеваний (эндометриоз, миома матки и т.д.), репродуктивной патологии (бесплодие), заболеваний, осложняющих беременность (сахарный диабет 1 и 2 типа, сердечно-сосудистые заболевания и т.д.), а также наследственных заболеваний.

    Перспективы научных исследований

    • Поиск биомаркеров распространённых мультифакторных патологий, включая частые акушерские патологии и нарушения репродуктивной функции
    • Разработка и валидация методов проведения диагностики наследственных заболеваний, в том числе с целью ПД и ПГТ-М
    • Создать биобанк образцов наследственных и распространенных мультифакторными заболеваний с ассоциированной информацией (демографические и антропометрические данные, информация о клинических и лабораторных исследованиях и др.)
    • Развитие направления, связанного с неинвазивными пренатальными исследованиями

    Наиболее важные публикации за последние 5 лет

    1. Glotov A.S., Tiys E.S., Vashukova E.S., Pakin V.S., Demenkov P.S., SaikO.V., Ivanisenko T.V., Arzhanova O.N., Mozgovaya E.V., Zainulina M.S., Kolchanov N.A., Baranov V.S., Ivanisenko V.A. Associative networks of potential molecular and genetic contributors in combined preeclampsia (preeclampsia associome) // BMC Systems biology. 2015. V.9. S. 4. P. 2-12. doi: 10.1186/1752-0509-9-S2-S4 (Impact Factor: 2.85)
    2. Glotov A.S., Kazakov S.V., Zhukova E.A., Alexandrov A.V., Glotov O.S., Pakin V.S., Danilova M.M., Tarkovskaya I.V., Niyazova S.V., Chakova N.N., Komissarova S.M., Kurnikova E.A., Sarana A.M., Sherbak S.G., Sergushichev A.A., Shalyto A.A., Baranov V.S. Targeted next-generation sequencing (NGS) of nine candidate genes with custom AmpliSeq in patients and a cardiomyopathy risk group // Clinica Chimica Acta. 2015. V. 15; 446. P. 132-140. doi: 10.1016/j.cca.2015.04.014. (Impact Factor: 2.76)
    3. Vashukova E.S., Glotov A.S., Fedotov P.V., Efimova O.A., Pakin V.S., Mozgovaya E.V., Pendina A.A., Tikhonov A.V., Koltsova A.S., Baranov V.S. Placental microRNA expression in pregnancies complicated by superimposed pre-eclampsia on chronic hypertension // Molecular Medicine Reports 2016. 14 22-32. doi: 10.3892/mmr.2016.5268 (Impact Factor: 1.554)
    4. Glotov A.S., Sinitsyna E.S., Danilova M.M., Vashukova E.S., Walter J.G., Stahl F., Baranov V.S., Vlakh E.G., Tennikova T.B. Detection of human genome mutations associated with pregnancy complications using 3-D microarray based on macroporous polymer monoliths // Talanta. 2016. Jan 15;147:537-46. doi: 10.1016/j.talanta.2015.09.066. (Impact Factor: 3.545)
    5. Barbitoff Y.A., Serebryakova E.A., Nasykhova Y.A., Predeus A.V., Polev D.E. Shuvalova A.R., Vasiliev E.V., Urazov S.P.,  Sarana A.M., Scherbak S.G., Gladyshev D.V., Pokrovskaya M.S.,  Sivakova O.V., Meshkov A.N, Glotov O.S., Glotov A.S. Identification of novel candidate markers of type 2 diabetes and obesity in Russia by exome sequencing with a limited sample size // Genes. 2018. Special Issue Computational Approaches for Disease Gene Identification. 9(8), 415. doi.org/10.3390/genes9080415 (Impact Factor: 3.191)
    6. Osinovskaya NS, Malysheva OV, Shved NY, Ivashchenko TE, Sultanov IY, Efimova OA, Yarmolinskaya MI, Bezhenar VF, Baranov VS. Frequency and Spectrum of MED12 Exon 2 Mutations in Multiple Versus Solitary Uterine Leiomyomas From Russian Patients // Int J Gynecol Pathol. 2016 Nov;35(6):509-515. doi: 10.1097/PGP.0000000000000255.
    7. Barbitoff YA, Skitchenko RK, Poleshchuk OI, Shikov AE, Serebryakova EA, Nasykhova YA, Polev DE, Shuvalova AR, Shcherbakova IV, Fedyakov MA, Glotov OS, Glotov AS, Predeus AV. Whole-exome sequencing provides insights into monogenic disease prevalence in Northwest Russia. Mol Genet Genomic Med. 2019 Nov;7(11): e964. doi: 10.1002/mgg3.964. Epub 2019 Sep 3.
    8. Nasykhova YA, Barbitoff YA, Serebryakova EA, Katserov DS, Glotov AS. Recent advances and perspectives in next generation sequencing application to the genetic research of type 2 diabetes. World J Diabetes 2019; 10(7): 376-395
    9. Glotov OS, Serebryakova EA, Turkunova ME, Efimova OA, Glotov AS, Barbitoff YA, Nasykhova YA, Predeus AV, Polev DE, Fedyakov MA, Polyakova IV, Ivashchenko TE, Shved NY, Shabanova ES, Tiselko AV, Romanova OV, Sarana AM, Pendina AA, Scherbak SG, Musina EV, Petrovskaia-Kaminskaia AV, Lonishin LR, Ditkovskaya LV, Zhelenina LА, Tyrtova LV, Berseneva OS, Skitchenko RK, Suspitsin EN, Bashnina EB, Baranov VS. Whole exome sequencing in Russian children with non type 1 diabetes mellitus reveals a wide spectrum of genetic variants in MODY related and unrelated genes. Mol Med Rep. 2019 Dec;20(6):4905-4914. doi: 10.3892/mmr.2019.10751. Epub 2019 Oct 16.
    10. Balashova M.S., Tuluzanovskaya I.G., Glotov O.S., Glotov A.S., Barbitoff Y.A., Fedyakov M.A., Alaverdian D.A., Ivashchenko T.E., Romanova O.V., Sarana A.M., Scherbak S.G., Baranov V.S., Filimonov M.I., Skalny A.V., Zhuchenko N.A., Ignatova T.M., Asanov A.Y. The spectrum of pathogenic variants of the ATP7B gene in Wilson disease in the Russian Federation // Journal of Trace Elements in Medicine and Biology J Trace Elem Med Biol. 2019 Oct 25:126420. doi: 10.1016/j.jtemb.2019.126420. [Epub ahead of print] (Impact Factor Impact Factor: 2.895).
    11. Gerasimova E.M., Fedotov S.A., Kachkin D.V., Vashukova E.S., Glotov A.S., Chernoff Y.O., Rubel A.A. Protein misfolding during pregnancy: New approaches to preeclampsia diagnostics // International Journal of Molecular Sciences. 2019. V. 20, 24, 6183 https://doi.org/10.3390/ijms20246183 (Impact Factor Impact Factor: 4.183).
    12. Рыжкова О.П., Кардымон О.Л., Прохорчук Е.Б., Коновалов Ф.А., Масленников А.Б., Степанов В.А., Афанасьев А.А., Заклязьминская Е.В., Ребриков Д.В., Савостьянов К.В., Глотов А.С., Костарева А.А., Павлов А.Е., Голубенко М.В., Поляков А.В., Куцев С.И. Руководство по интерпретации данных последовательности ДНК человека, полученных методами массового параллельного секвенирования (MPS) (редакция 2018, версия 2) // Медицинская генетика. 2019. Т. 18. № 2. С. 3-23.
    13. Baranov VS, Osinovskaya NS, Yarmolinskaya MI. Pathogenomics of Uterine Fibroids Development // Int J Mol Sci 2019 Dec 6;20(24):6151. doi: 10.3390/ijms20246151.
    14. Barbitoff Y.A., Polev D.E., Glotov A.S.  Serebryakova E.S., Shcherbakova I.V., Kiselev A.M., Kostareva A.A., Glotov O.S., Predeus A.V. Systematic dissection of biases in whole-exome and whole-genome sequencing reveals major determinants of coding sequence coverage // Sci Rep 10, 2057 (2020). https://doi.org/10.1038/s41598-020-59026-y (Impact Factor: 4.525)

    Патенты

    1. Патент №2412247 от 20.02.2011. Пинелис В.Г., Симонова О.И., Журкова Н.В., Аверьянова Н.С., Асанов А.Ю., Баранов А.А., Глотов А.С., Потулова С.В., Глотов О.С., Иващенко Т.Э., Баранов В.С., Айламазян Э.К. Способ анализа генетического полиморфизма для проведения постнатальной ДНК-диагностики муковисцидоза.
    2. Патент №2431842 20.10.2011Глотов А.С., Вашукова Е.С., Бикмуллина Д.Р., Зайнуллина М.С., Баранов В.С., Айламазян Э.К. Способ прогнозирования риска развития гестоза на основе генетических маркеров.
    3. Свидетельство о государственной регистрации базы данный №2019620756, 17.05.2019. Козюлина П.Ю., Глотов А.С., Вашукова Е.С., Двойнова Н.М., Капустин Р.В. “База данных миРНК для аннотации и интерпретации данных молекулярно-генетических исследований при акушерских и гинекологических заболеваниях” (miRNAPregnancyDB).

    Гранты

    • РНФ 19-75-20033 «Изучение в динамике транскриптомных и протеомных маркеров риска тяжелых осложнений беременности, приводящих к преждевременным родам» (2019 – 2022 гг.)
    • РНФ 19-75-20033 «Исследование эндометриоза и миомы матки с позиций трансляционной медицины» (2019 – 2021 гг.)
    • НИР 004-2/53/2018/1 «Исследования по разработке молекулярно-генетических методов анализа психофизиологических особенностей человека» (2018-2020 гг.)
    • НИР 029-2/53/2019/1 «Разработка биоинформатического протокола по выявлению структурных изменений в геноме человека, животных и растений» (2019 -2020 гг.)
    • Государственный контракт на выполнение научно-исследовательских работ №16.512.11.2035 «Исследование генетических маркеров, определяющих фенотипические (рост, вес, ИМТ, ОТ/ОБ) и биохимические (спектр липидов) признаки человека, с целью разработки наборов реагентов для идентификации личности».

    Уникальное оборудование

    Лаборатория геномики с группой биоресурсных коллекций Отдела геномной медицины ФГБНУ «НИИ АГиР им. Д. О. Отта» оснащена современным научно-исследовательским оборудованием для выполнения молекулярно-генетических исследований, соответствующим мировым стандартам, в том числе:

    • платформа Ion Torrent Ion S5 System и система автоматической пробоподготовки Ion Chef System (ThermoFisher Scientific);
    • генетические анализаторы для капиллярного секвенирования ABI-3130, ABI-3130xl Genetic Analyzer (ThermoFisher Scientific);
    • оборудование для выполнения сравнительной геномой гибридизации на микроматрицах (сканер Perkin Elmer Scan RI, ПО Agilent Cytogenomics, CGH Microarray platform (Agilent)).

    Международные научные проекты

    В сотрудничестве с Университетом г. Тарту Лаборатория геномики с группой биоресурных коллекций принимает участие в реализации проекта ER24 «Development of measures for improving the quality of diagnosis  and prevention of type 2 diabetes», финансируемого международной программой Estonia-Russia Cross-Border Cooperation Programme.

    Лаборатория молекулярной генетики и генной терапии

    Основные направления исследований

    • Исследование подходов к генной терапии эндометриоза и миомы матки
    • Изучение молекулярно-генетических основ патогенеза и поиск подходов к генотерапии спинальной мышечной атрофии
    • Разработка невирусных систем доставки генетических конструкций в клетки
    • Изучение способов преодоления вне- и внутриклеточных барьеров транспорта нуклеиновых кислот

    Наиболее значимые результаты для науки и практики

    • Разработана невирусная система направленной доставки малых интерферирующих РНК на основе пептидов, модифицированных лигандом рецептора CXCR4
    • Научно обоснован подход к анти-ангиогенной терапии эндометриоза с помощью доставки в очаги заболевания малых интерферирующих РНК в составе нуклеопептидных наночастиц
    • Изучено влияние метилирования нескольких генов на тяжесть спинальной мышечной атрофии
    • Исследован синергистический анти-ангиогенный эффект комбинированной доставки миРНК против генов VEGFA, VEGFR1 и ENG

    Перспективы научных исследований

    • Разработка подходов к генной терапии эндометриоза, основанных на направленной доставке миРНК с помощью невирусных носителей
    • Разработка подходов к суицидной генной терапии миомы матки
    • Создание новых невирусных систем направленной доставки ДНК и миРНК на основе пептидов, модифицированных лигандами αV- интегринов
    • Изучение способов преодоления внеклеточных барьеров транспорта генетических конструкций с помощью поверхностной модификации нуклеопептидных комплексов
    • Поиск подходов к олигонуклетидной терапии спинальной мышечной атрофии
    • Разработка невирусных способов доставки конструкций для геномного редактирования

    Наиболее важные публикации за последние 5 лет

    1. Egorova A.A., Kiselev A.V. Peptide Modules for Overcoming Barriers of Nucleic Acids Transport to Cells // Current Topics in Medicinal Chemistry, 2016, 16 (3) P. 330-342.
    2. Egorova, A., Shubina, A., Sokolov, D., Selkov, S., Baranov, V., Kiselev, A. CXCR4-targeted modular peptide carriers for efficient anti-VEGF siRNA delivery. // International Journal of Pharmaceutics, 2016, 515(1), 431-440.
    3. Bogacheva, M., Egorova, A., Slita, A., Maretina, M., Baranov, V., Kiselev, A. Arginine-rich cross-linking peptides with different SV40 nuclear localization signal content as vectors for intranuclear DNA delivery. // 2017. Bioorganic and Medicinal Chemistry Letters, 27 (21), pp. 4781-4785.
    4. Anna Slita, Anna Egorova, Eudald Casals, Anton Kiselev, Jessica M. Rosenholm. Characterization of modified mesoporous silica nanoparticles as vectors for siRNA delivery // Asian Journal of Pharmaceutical Sciences, 2018, pp. 1-8.
    5. Marianna A. Maretina,  Galina Y. Zheleznyakova,  Kristina M. Lanko,  Anna A. Egorova,  Vladislav S. Baranov, Anton V. Kiselev Molecular Factors Involved in Spinal Muscular Atrophy Pathways as Possible Disease-modifying Candidates // Current Genomics, volume 19, issue 5, pages 339 - 355, year 2018.
    6. Anna Egorova, Mariya Petrosyan, Marianna Maretina, Natalia Balashova, Lyudmila Polyanskih,Vladislav Baranov, Anton Kiselev Anti-angiogenic treatment of endometriosis via anti-VEGFA siRNA delivery by means of peptide-based carrier in a rat subcutaneous model // Gene Therapy, 2018, volume 25, pages 548–555.
    7. Marianna A. Maretina,  Anna A. Egorova,  Vladislav S. Baranov, Anton V. Kiselev DYNC1H1 gene methylation correlates with severity of spinal muscular atrophy // Annals of Human Genetics, 2019, volume 83, issue 2, pages 73-81.
    8. Valetdinova KR, Maretina MA, Kuranova ML, Grigor'eva EV, Minina YM, Kizilova EA, Kiselev AV, Medvedev SP, Baranov VS, Zakian SM. Generation of two spinal muscular atrophy (SMA) type I patient-derived induced pluripotent stem cell (iPSC) lines and two SMA type II patient-derived iPSC lines. // Stem cell research. 2019 Jan 11:101376.
    9. Egorova A.A., Maretina M.A., Kiselev A.V. (2019) VEGFA Gene Silencing in CXCR4-Expressing Cells via siRNA Delivery by Means of Targeted Peptide Carrier. In: Dinesh Kumar L. (eds) RNA Interference and Cancer Therapy. // Methods in Molecular Biology, vol 1974. Humana, New York, NY. P. 57-68.
    10. Egorova, A.A.; Shtykalova, S.V.; Maretina, M.A.; Sokolov, D.I.; Selkov, S.A.; Baranov, V.S.; Kiselev, A.V. Synergistic Anti-Angiogenic Effects Using Peptide-Based Combinatorial Delivery of siRNAs Targeting VEGFA, VEGFR1, and Endoglin Genes. // Pharmaceutics 2019, V.11, art. no. 261.
    11. Егорова А. А., Штыкалова С. В., Маретина М. А., Селютин А. В., Швед Н. Ю., Крылова Н. В., Ильина А. В., Пьянков И. А., Фрейнд С. А., Сельков С. А., Баранов В. С., Киселев А. В. Cys-фланкированные катионные пептиды для доставки гена тимидинкиназы вируса простого герпеса в клетки с целью суицидной генной терапии миомы матки // Молекулярная биология, 2020, том 54, № 3, с. 497-511.

    Монографии:

    1. Баранов В.С., Шубина А.Н., Егорова А.А., Киселев А.В. Генная терапия эндометриоза / в кн. Генитальный эндометриоз. Различные грани проблемы. под ред. Ярмолинской М.И., Айламазяна Э.К.// СПб.: Эко-Вектор, 2017. – 615 с. Стр. 481-491.

    Лаборатория цитогенетики и цитогеномики репродукции

    Основные направления исследований

    • Генетика, цитогеномика и эпигеномика репродукции человека
    • Струтурно-функциональная организация хромосом человека
    • Роль аномалий кариотипа в патогенезе миомы матки
    • Оптимизация алгоритмов цитогенетической диагностики

    Наиболее значимые результаты для науки и практики

    • Впервые описана динамика эпигенетического репрограммирования хромосом эмбрионов человека до и после имплантации (Pendina et al., 2011; Efimova et al., 2015; Pendina et al., 2018; Efimova et al., 2018; Efimova et al., 2019)
    • Впервые установлена взаимосвязь между содержанием в сперматозоидах гидроксиметилированной ДНК и качеством спермы (Efimova et al., 2017)
    • Показана взаимосвязь эпигенетического статуса клеток миом матки с гормональным статусом (Kol’tsova et al., 2017)
    • Впервые охарактеризована цитогенетическая картина хромотрипсиса в миоме (Pendina et al., 2017)
    • Разработан алгоритм выявления цитогенетических причин остановки развития беременности, основанный на применении стандартного цитогенетического исследования и флуоресцентной in situ гибридизации (FISH) с использованием ДНК-зондов на 23 хромосомы кариотипа
    • Установлено, что цитогенетические аномалии хориона не являются доминирующей причиной остановки развития беременности у пациенток, забеременевших с помощью ЭКО (Pendina et al., 2014)
    • Разработан алгоритм маршрутизации пациентов с редкой и уникальной хромосомной патологией с целью комплексного персонифицированного обследования при подготовке и ведении беременности (Pendina et al., 2019).

    Перспективы научных исследований

    • Изучение фундаментальных основ генетической и эпигенетической регуляции гаметогенеза и эмбриогенеза человека
    • Поиск новых маркеров, в том числе эпигенетических, и разработка дополнительных критериев оценки репродуктивного потенциала супружеских пар
    • Изучение роли цитогенетических факторов в патогенезе миомы матки и их взаимосвязи с гормональным статусом
    • Анализ и систематизация редких и уникальных случаев хромосомной патологии у пациентов с репродуктивными проблемами

    Наиболее важные публикации за последние 5 лет

    1. Efimova OA, Koltsova AS, Krapivin MI, Tikhonov AV, Pendina AA. Environmental Epigenetics and Genome Flexibility: Focus on 5-Hydroxymethylcytosine. Int J Mol Sci. 2020 May 2;21(9):E3223. doi: 10.3390/ijms21093223.
    2. Puppo IL, Saifitdinova AF, Loginova YA,  Kinunen AA, Tonyan ZN, Pastukhova YR, Leontyeva OA, Kuznetsova RA, Chiryaeva OG, Pendina AA, Efimova OA, Tikhonov AV, Petrovskaia-Kaminskaia AV, Dudkina VS, Petrova LI, Polyakova IV, Shcherbak SG, Glotov OS, Bichevaya NK. Y/15 and Y/22 Derivative Chromosomes in Couples with Reproductive Failures: Algorithm of Preimplantation Genetic Testing and Specificity of Inheritance. Russ J Genet. 2020, 56, 488–495. https://doi.org/10.1134/S1022795420040110.
    3. Koltsova AS, Pendina AA, Efimova OA, Chiryaeva OG, Kuznetzova TV, Baranov VS.  On the Complexity of Mechanisms and Consequences of Chromothripsis: An Update. Front Genet. 2019 Apr 30;10:393. doi: 10.3389/fgene.2019.00393.
    4. Khavinson VK, Pendina AA, Efimova OA, Tikhonov AV, Koltsova AS, Krapivin MI, Petrovskaia-Kaminskaia AV, Petrova LI, Lin'kova NS, Baranov VS. Effect of Peptide AEDG on Telomere Length and Mitotic Index of PHA-Stimulated Human Blood Lymphocytes. Bull Exp Biol Med. 2019 Nov;168(1):141-144. doi: 10.1007/s10517-019-04664-0.
    5. Ivashchenko T.E., Vashukova E.S., Kozyulina P.Yu., Dvoynova N.M., Talantova O.E., Koroteev A.L., Pendina A.A., Tikhonov A.V., Chiryaeva O.G., Petrova L.I., Dudkina V.S., Efimova O.A., Baranov V.S., Glotov A.S. Noninvasive Prenatal Testing Using Next Generation Sequencing: Pilot Experience of the D.O. Ott Research Institute of Obstetrics, Gynecology and Reproductology. Russian Journal of Genetics. 2019; 55(10): 1208–1213.
    6. Pendina AA, Shilenkova YV, Talantova OE, Efimova OA, Chiryaeva OG, Malysheva OV, Dudkina VS, Petrova L'I, Serebryakova EA, Shabanova ES, Mekina ID, Komarova EM, Koltsova AS, Tikhonov AV, Tral TG, Tolibova GK, Osinovskaya NS, Krapivin MI, Petrovskaia-Kaminskaia AV, Korchak TS, Ivashchenko TE, Glotov OS, Romanova OV, Shikov AE, Urazov SP, Tsay VV, Eismont YA, Scherbak SG, Sagurova YM, Vashukova ES, Kozyulina PY, Dvoynova NM, Glotov AS, Baranov VS, Gzgzyan AM and Kogan IY (2019) Reproductive History of a Woman With 8p and 18p Genetic Imbalance and Minor Phenotypic Abnormalities. Front. Genet. 10:1164. doi: 10.3389/fgene.2019.01164.
    7. Pendina AA, Efimova OA, Krapivin MI, Mekina ID, Tikhonov AV, Koltsova AS, Petrovskaia-Kaminskaia AV, Chiryaeva OG, Kogan IY, Gzgzyan AM, Baranov VS. Genomic distribution of 5-formylcytosine and 5-carboxylcytosine in human preimplantation embryos. Mol Reprod Dev. 2018 Dec;85(12):893-895. doi: 10.1002/mrd.23074.
    8. Efimova OA, Pendina AA, Krapivin MI, Kopat VV, Tikhonov AV, Petrovskaia-Kaminskaia AV, Navodnikova PM, Talantova OE, Glotov OS, Baranov VS. Inter-Cell and Inter-Chromosome Variability of 5-Hydroxymethylcytosine Patterns in Noncultured Human Embryonic and Extraembryonic Cells. Cytogenet Genome Res. 2018;156(3):150-157. doi: 10.1159/000493906.
    9. Efimova OA, Pendina AA, Tikhonov AV, Baranov VS. The Evolution of Ideas on the Biological Role of 5-methylcytosine Oxidative Derivatives in the Mammalian Genome. Russian Journal of Genetics: Applied Research 2018; 8 (1): 11-21. doi: 10.1134/S2079059718010069.
    10. Pendina AA, Koltsova AS, Efimova OA, Malysheva OV, Osinovskaya NS, Sultanov IY, Tikhonov AV, Shved NY, Chiryaeva OG, Simareva AD, Kakhiani MI, Baranov VS. Case of chromothripsis in a large solitary non-recurrent uterine leiomyoma. Eur J Obstet Gynecol Reprod Biol. 2017 Dec;219:134-136. doi: 10.1016/j.ejogrb.2017.10.028.
    11. Efimova OA, Pendina AA, Tikhonov AV, Parfenyev SE, Mekina ID, Komarova EM, Mazilina MA, Daev EV, Chiryaeva OG, Galembo IA, Krapivin MI, Glotov OS, Stepanova IS, Shlykova SA, Kogan IY, Gzgzyan AM, Kuznetzova TV, Baranov VS. Genome-wide 5-hydroxymethylcytosine patterns in human spermatogenesis are associated with semen quality. Oncotarget. 2017 Jun 1. 8(51):88294-88307. doi: 10.18632/oncotarget.18331.
    12. Kol'tsova AS, Pendina AA, Efimova OA, Kaminskaya AN, Tikhonov AV, Osinovskaya NS, Sultanov IY, Shved NY, Kakhiani MI, Baranov VS. Differential DNA Hydroxymethylation in Human Uterine Leiomyoma Cells Depending on the Phase of Menstrual Cycle and Presence of MED12 Gene Mutations. Bull Exp Biol Med. 2017 Sep 25; 163(5):646-649. doi: 10.1007/s10517-017-3870-3.
    13. Efimova OA, Pendina AA, Tikhonov AV, Fedorova ID, Krapivin MI, Chiryaeva OG, Shilnikova EM, Bogdanova MA, Kogan IY, Kuznetzova TV, Gzgzyan AM, Ailamazyan EK, Baranov VS. Chromosome hydroxymethylation patterns in human zygotes and cleavage-stage embryos. Reproduction. 2015; 149 (3): 223-233.
    14. Efimova OA, Pendina AA, Tikhonov AV, Kuznetzova TV, Baranov VS. Oxidized form of 5-methylcytosine—5-hydroxymethylcytosine: a new insight into the biological significance in the mammalian genome. Russian Journal of Genetics: Applied Research 2015; 5 (2): 75-81.

    Монографии:

    1. A.A. Pendina, O.A. Efimova, A.V. Tikhonov, O.G. Chiryaeva, I.D. Fedorova, A.S. Koltsova, M.I. Krapivin, S.E. Parfenyev, T.V. Kuznetzova, V.S. Baranov. Immunofluorescent staining for cytosine modifications like 5-methylcytosine and its oxidative derivatives and FISH, in «Fluorescence In Situ Hybridization (FISH): Application Guide» 2nd Edition, edited by T. Liehr, Springer-Verlag Berlin Heidelberg, 2017, pp.  337-346; ISBN 978-3-662-52957-7, ISBN 978-3-662-52959-1 (eBook), DOI: 10.1007/978-3-662-52959-1, Pages: 606.

    Патенты

    Патент на изобретение № 2673472, приоритет изобретения 30.11.2017 г. «Способ оценки качества эякулята по содержанию сперматозоидов с гидроксиметилированной ДНК». Авторы: Пендина А.А., Ефимова О.А., Парфеньев С.Е., Мекина И.Д., Комарова Е.М., Тихонов А.В., Мазилина М.А., Коган И.Ю., Гзгзян А.М., Крапивин М.И., Петровская-Каминская А.В., Чиряева О.Г., Баранов В.С. Патентообладатель: Федеральное государственное бюджетное научное учреждение "Научно-исследовательский институт акушерства, гинекологии и репродуктологии имени Д.О. Отта" (ФГБНУ "НИИ АГиР им. Д.О. Отта").

    Гранты

    • Грант РНФ № 18-75-10046 "Влияние генетических и эпигенетических характеристик половых клеток на оплодотворение и раннее развитие эмбрионов человека in vitro", 2018-2021 гг.
    • Грант РНФ 19-75-00023 "Изучение длины теломер и факторов, влияющих на ее динамическое равновесие, при внутриутробной гибели эмбрионов человека", 2019-2021 гг.

    Уникальное оборудование

    • Исследовательский универсальный моторизованный микроскоп Axio Imager.Z2 (Carl Zeiss, Германия), оборудованный цветной и черно-белой камерами высокого разрешения и системой анализа изображений IKAROS / ISIS (MetaSystems, Германия).
    • Универсальный лабораторный флуоресцентный микроскоп Leica DM 2500, оборудованный камерой Leica DFC345 FX и ПО Leica Application SuiteV.3.8.0 software.
  • Биоресурсная коллекция «Репродуктивное здоровье человека»

    Проект Биоресурсная коллекция «Репродуктивное здоровье человека»

    Биоресурсная коллекция «Репродуктивное здоровье человека» организована для выполнения проекта «Многоцентровая исследовательская биоресурсная коллекция «Репродуктивное здоровье человека», выполняемого при финансовой поддержке гранта в форме субсидии на выполнение отдельных мероприятий Федеральной научно-технической программы развития генетических технологий на 2019 – 2027 годы, утвержденной постановлением Правительства Российской Федерации от 22 апреля 2019 г. № 479 "Об утверждении Федеральной научно - технической программы развития генетических технологий на 2019 - 2027 годы" (далее - Федеральная программа) в рамках федерального проекта "Развитие масштабных научных и научно-технологических проектов по приоритетным исследовательским направлениям" национального проекта "Наука и университеты". Проект нацелен на решение четырех важных стратегических задач - обеспечение Российской Федерации новой высокопроизводительной современной инфраструктурой в области биобанкирования, создание на ее базе уникальной многоцентровой исследовательской биоресурсной коллекции “Репродуктивное здоровье человека”, развитие на основе созданной коллекции научных и практических решений в области генетических технологий, а также подготовка новых специалистов в области биобанкирования. БРК формируется организациями, входящими в состав Сетевого Российского Центра БРК «Репродуктивное здоровье человека» - ФГБНУ «НИИ АГиР им. Д.О.Отта» (г. Санкт-Петербург), ФГБНУ «МГНЦ» (г. Москва) и БУ ВО «Сургутский государственный университет» (г. Сургут).

    Модель сетевого взаимодействия БРК

    Цель: Создание и развитие биоресурсной коллекции образцов биоматериала пациентов с многофакторными и моногенными наследственными заболеваниями, значимыми для репродукции, а также разработка и реализация мероприятий, направленных на повышение востребованности и доступности биоресурной коллекции.

    Задачи:

    1. Организовать Сетевой Российский Центр биоресурсной коллекции образцов от пациентов с многофакторными и моногенными наследственными заболеваниями, значимыми для репродукции, включающий ведущие научно-исследовательские и образовательные организации.
    2. Модернизировать и дооснастить инфраструктуру организаций, входящих в состав Сетевого Центра, до аналогов мирового уровня.
    3. Провести инвентаризацию и систематизацию биообразцов из существующих коллекций ФГБНУ “НИИ АГиР им. Д.О. Отта”, ФГБНУ “МГНЦ” и БУ ВО “СурГУ”, а также пополнить биоресурсную коллекцию образцами биологического материала различного типа (цельная кровь, плазма, сыворотка, лейкоцитарная пленка, образцы ДНК, моча, биоптаты плаценты, клеточные культуры, образцы семенной жидкости и семенной плазмы, препараты соматических и половых клеток) от не менее, чем 5 000 пациентов (не менее 40 000 образцов) с нарушениями репродуктивной системы.
    4. Разработать технологический паспорт с описанием полного набора СОПов, обеспечивающих создание, поддержание и развитие коллекционного фонда.
      1. Разработать и экспериментально верифицировать стандартные операционные процедуры (не менее 20) для процессов обработки, анализа, хранения и проведения контроля качества биоматериала разного типа, полученного от пациентов с нарушениями репродуктивной функции, и культур клеток;
      2. Разработать и экспериментально верифицировать стандартные операционные процедуры (не менее 20) для отработки молекулярно-генетических методов, в том числе секвенирования следующего поколения, необходимых для характеризации образцов биоколлекций;
      3. Разработать и экспериментально верифицировать стандартные операционные процедуры (не менее 10) для отработки цитогенетических и молекулярно-цитогенетических и других методов, необходимых для характеризации образцов биоколлекций.
    5. Оптимизировать документооборот основных процессов сбора, хранения, исследования и распространения биообразцов, применяемый в организациях-партнерах, включая создание и внедрение унифицированных стандартов документов и электронной системы документооборота, с целью повышения эффективности работы с пользователями и обеспечения доступности и востребованности биоресурсной коллекции.
    6. Охарактеризовать образцы биоресурсной коллекции с применением молекулярно-генетических, цитогенетических и молекулярно-цитогенетических методов исследования.
      1. Разработать алгоритм генетического обследования пациентов с нарушением репродуктивной функции.
      2. Охарактеризовать спектр и частоту генетических вариантов в образцах пациентов (не менее 300) с заболеваниями женской репродуктивной системы (включая преэклампсию, гестационный сахарный диабет, поликистоз яичников, невынашивание беременности, преждевременные роды, синдром задержки роста плода), а также в контрольной выборке, в том числе, с применением метода высокопроизводительного секвенирования;
      3. Выполнить анализ числовых и структурных хромосомных аномалий у пациентов с нарушениями развития и/или функции репродуктивной функции методами стандартного кариотипирования, флуоресцентной in situ гибридизации и сравнительной геномной гибридизации на микроматрицах (хромосомный микроматричный анализ) (не менее 100);
      4. Проанализировать цитогенетически идентифицируемые и микроструктурные хромосомные аномалии/вариации числа копий (CNV), а также генные варианты, вовлеченные в остановку эмбрионального развития, в образцах абортивного материала и/или трио (мать-отец-плод) при ранних репродуктивных потерях (не менее 100);
      5. Охарактеризовать спектр и частоту патогенных вариантов у 300 пациентов с моногенными заболеваниями, ассоциированными с нарушениями репродуктивной системы или высоким риском осложненного течения беременности (врожденная дисфункция коры надпочечников, муковисцидоз и др.);
      6. С помощью анализа микроделеций Y-хромосомы, анализа мутаций гена CFTR, хромосомного микроматричного анализа, а также секвенирования экзома/генома, проанализировать частоту и спектр патогенных вариантов у пациентов с мужским бесплодием, связанным с патозооспермией неясного генеза (не менее 100).
    7. Провести оценку вклада числовых и структурных хромосомных нарушений, а также генных мутаций в структуре причин нарушений женской/мужской репродуктивной функции и ранних репродуктивных потерь.
      1. Оценить возможность использования выявленных генетических маркеров для доклинического предсказания риска развития нарушений репродуктивной системы.
      2. Оценить влияние хромосомных и моногенных заболеваний в этиологии ранних репродуктивных потерь.
      3. Осуществить поиск патогенных генетических вариантов, ассоциированных с остановкой развития беременности (невынашивания) при нормальном (эуплоидном) кариотипе методом полноэкзомного секвенирования.
      4. Оценить вклад патогенных генетических вариантов в этиологию мужского бесплодия, связанного с патозооспермией неясного генеза.
      5. Разработать подходы для построения модели прогнозирования нарушений репродуктивной функции на основе нейронных сетей различной архитектуры.
    8. Разработать и внедрить образовательную программу повышения квалификации на основе требований ФГОС ВО и профессиональных стандартов в области биобанкирования для обучения специалистов, задействованных в репродуктологии, акушерстве и гинекологии.
    9. Разработать и внедрить Интернет-ресурс для доступа к созданному каталогу биообразцов, находящихся на хранении в организациях Сетевого Центра и Национальной базы генетической информации (НБГИ), с возможностью просмотра, поиска, фильтрации и выбора биообразцов пользователем.
    10. Разработать уникальный программный компонент, позволяющий интегрировать данные в каталоге биообразцов Сетевого Центра с информацией из различных публичных научных ресурсов, включая НБГИ.

    Биоресурсная коллекция «Репродуктивное здоровье человека»

    В состав входят инвентаризированные и систематизированные образцы биологического материала различного типа (цельная венозная кровь, образцы ДНК, образцы эякулята и зафиксированные препараты соматических и половых клеток). Кроме того, БРК пополняется образцами биоматериала (цельная венозная кровь, сыворотка, плазма, лейкоцитарная пленка матери и плода, биоптаты плаценты, образцы ДНК и РНК, образцы мочи, семенная жидкость (эякулят), семенная плазма, фиксированные половые и соматические клетки, биоптаты гонад) от пациентов с гинекологическими, акушерскими и репродуктивными заболеваниями или индивидуумов контрольной группы. Сбор, обработка и хранение биологического материала БРК организованы в соответствии с международными требованиями обществ ISBER, BBMRI-ERIC. Для стандартизации работы и повышения качества исследований созданы и валидированы стандартные операционными процедурами (СОП) на основные процессы. Выполняемые систематизация и проверка качества работы с образцами, а также наличие низкотемпературных морозильных установок с необходимыми режимами хранения обеспечивают длительную сохранность биологического материала и возможность его использования в других исследованиях, в том числе и сторонними организациями при выполнении совместных проектов.

       

    Направления научных исследований, реализуемые с использованием БРК

    • нарушения репродуктивной функции (невынашивание беременности, мужское/женское бесплодие);
    • тяжелая акушерская патология (плацентарная недостаточность, задержка роста плода, преэклампсия, преждевременные роды и т. д.);
    • разработка и внедрение новых биомедицинских технологий в области репродукции человека.

    Биобанк «ГЕНОФОНД»

    На базе Отдела геномной медицины ФГБНУ «НИИ АГиР им. Д.О. Отта» организовано отделение «Биобанк «ГЕНОФОНД».

    Деятельность Биобанка «ГЕНОФОНД» направлена на оказание услуг по биобанкированию и процессингу образцов в рамках фундаментальных и прикладных проектов, выполняемых исследователями и научными коллективам как Института, так и внешними пользователями, на имеющемся в отделении научном оборудовании в форме коллективного пользования.

    Задачи подразделения

    • прием, сбор, процессинг, ответственное хранение и выдача охарактеризованных биологических образцов различного типа пользователям Биобанка для научных исследований;
    • консалтинг, квалифицированное обеспечение и участие в биомедицинских исследованиях, в т.ч. с использованием имеющегося в распоряжении отделения научного оборудования;
    • оказание консультационной поддержки исследователей по методическим и техническим вопросам, связанным с профилем работ, выполняемых коллективом отделения;
    • обеспечение стандартизации и качества биоматериала, используемого в научных исследованиях;
    • реализация мероприятий программы развития отделения в рамках фундаментальных и прикладных исследований по приоритетным направлениям.

    Научные направления деятельности

    • прием, хранение и выдача образцов биологического материала в соответствии с протоколами разделов систематизированного хранения образцов;
    • оптимизация имеющихся и внедрение новых современных методов работы с поступающим биоматериалом;
    • организация школ и конференций в области биобанкирования, а также участие в них;
    • участие в реализации фундаментальных и практических научных исследованиях в рамках государственных заданий, грантов, исследовательских проектов; выступления с докладами и подготовка научных публикаций по результатам выполненной работы.

    Контактная информация

    Телефон: (812)328-98-09
    Электронная почта: labpd@ott.ru

    Документы

    Договор
    Договор
    Реестр услуг
    Регламент оказания услуг и выполнения работ
    Форма заявки на выполнение работ и оказание услуг
    Форма заявки на выполнение работ и оказание услуг

  • Отдел патоморфологии

    В состав Отдела патоморфологии входят:

    Отдел патоморфологии с мировым именем и вековой историей был создан в 2010 году на базе лаборатории нормальной и патологической морфологии и патологоанатомического отделения, основанного в 1914 году.  Основоположником лаборатории является врач акушер-гинеколог, гистолог, профессор, заслуженный деятель науки РСФСР Клавдия Петровна Улезко-Строганова (1858-1943), являющаяся основоположником репродуктивной и перинатальной морфологии в Имперской России. Научные работы были посвящены изучению злокачественных и неопластических изменений органов малого таза, нарушению плацентарной функции у женщин при различных патологиях. К. П. Улезко-Строганова и заложила основу изучения морфогенеза данных патологий в РФ, а коллекция биоматериалов имеет научно-историческую ценность. Морфологическая триада (научная, клиническая и образовательная) сформулированная Улезко-Строгановой К.П. заложила фундамент исследований в области акушерства и гинекологии на века.

    С 1971 по 1993 года руководителем лаборатории нормальной и патологической морфологии была доктор медицинских наук, профессор Калашникова Екатерина Петровна (1924-1993). Основоположник направления адаптации системы плод-плацента. Автор концепции плацентарной недостаточности, коллекции биоматериалов плацент (более 100 000 образцов) от женщин с различными заболеваниями. При личном участии Е.П. Калашниковой в Ленинграде в 1962 году была создана Центральная перинатальная прозектура. Екатерина Петровна являлась единственным членом РФ в Международной ассоциации плацентологов с 1992 года и консультантом всех перинатальных  прозектур по Ленинграду и Санкт-Петербургу. Под руководством Калашниковой Е.П. в лаборатории морфологии с 1963 по 1980 год работал Никитин Анатолий Илларионович (1938 г.р.). Многочисленные научные труды и разработки, полученные в лаборатории морфологии, легли в основу развития современных вспомогательных репродуктивных технологий в РФ. Под руководством Никитина А.И. в 1986 году в России появился на свет первый мальчик в результате ЭКО.

    Основные направления исследований

    Репродуктивная морфология – изучение морфогенеза, патогенеза, саногенеза эндометриальной дисфункции, воспалительных заболеваний органов малого, миомы матки, наружного генитального эндометриоза и аденомиоза, доброкачественной и неопластической трансформации шейки матки.

    Перинатальная морфология – изучение гравидарной трансформации эндометрия в абортивном материале, репродуктивных потерь ранних и поздних сроков; морфогенез, саногенез и танатогенез плодов, детей,  новорожденных и плацент.

    Наиболее значимые результаты для науки и практики

    Разработан инновационой алгоритм морфологической диагностики состояния эндометрия не имеющий аналогов.

    Разработаны референсные значения иммуногистохимических и иммунофлюоресцентных маркеров в эндометрии у женщин в норме и при патологии репродуктивных органов.

    Верифицированы основные аспекты:

    • морфогенеза (вариации трансформации эндометрия);
    • стероидогенеза (оценка рецепторного профиля);
    • иммуногенеза (диагностически значимые маркеры имунокомпетентных клеток, хемокинов, факторов роста);
    • ангиогенеза (верификация активации неоангиогенеза).

    Создана и внедрена в клиническую практику диагностическая панель алгоритма морфологической диагностики эндометрия при бесплодии, невынашивании беременности и неэффективных циклах ВРТ.

    Диагностическая панель:

    • хронического эндометрита;
    • рецепторного профиля;
    • эндометриальной дисфункции;
    • жидкостной цитологии и иммуноцитохимического исследования шейки матки.

    Разработан и внедрен в клиническую практику алгоритм диагностики абортивного материала в зависимости от эмбриогистологического срока с применением гистологического иммуногистохимичского методов у пациенток при естественно наступившей беременности и беременности после программ ВРТ.

    Перспективы научных исследований

    Планируется продолжить исследования по гравидарной трансформации эндометрия и диагностических критериях причин прерывания беременности.

    Роль эндометриального фактора при больших акушерских синдромах. Плацентарная недостаточность, как угрожающее внутриутробному и постнатальному развитию плода состояние в исходе проявления больших акушерских синдромов и тяжелой соматической патологии матери. Сахарный диабет и преэклампсия, их влияние на фето-плацентарный комплекс и формирование ЗРП.

    Основные научные работы

    1. Айламазян Э.К, Петросян М.А., Толибова Г.Х. и соавт. Культура эндометрия человека: модель изучения репродуктивной функции. Медицинский академический журнал. 2012:1: 28-35.
    2. Толибова Г. Х., Траль Т. Г, Клещёв М. А., Кветной И. М., Айламазян Э. К. Эндометриальная дисфункция: алгоритм гистологического и иммуногистохимического исследования. Журнал акушерства и женских болезней. 2015г: Т. 67; 4: 69-78.
    3. Толибова, Г.Х. Траль Т.Г., Клещев М.А. Эндометриальная дисфункция: алгоритм клинико-морфологического исследования: учебное пособие для врачей. Библиотека патологоанатома. Научно-практич. журнал им. Н. Н. Аничкова. 2016: 168: 44 с.
    4. Айламазян Э.К., Толибова Г.Х., Траль Т.Г. и соавт. Конфокальная лазерная сканирующая микроскопия. Верификация экспрессии рецепторов эстрогена и прогестерона в течение менструального цикла.  Молекулярная медицина 2017:3: 27-31.
    5. Траль Т.Г., Толибова Г.Х. и соавт. Молекулярно-морфологические особенности формирования хронической плацентарной недостаточности, обусловленной разными типами сахарного диабета  Сахарный диабет. 2020.23;2: 185-191.
    6. Толибова Г.Х., Траль Т.Г., Коган И.Ю. Морфологическая оценка гипопластичного (тонкого) эндометрия у женщин с неэффективными протоколами вспомогательных репродуктивных технологий. Журнал акушерства и женских болезней. 2020:69: 5: 39–48.
    7. Экстракорпоральное оплодотворение. Практическое руководство для врачей / под ред. И. Ю. Когана. — Москва : ГЭОТАР-Медиа.  2021; 368c.
    8. Эндометрий в репродукции: оценка функции и возможности коррекции,  Руководство для врачей / под ред. И. Ю. Когана. Москва : ГЭОТАР-Медиа, 2022. 480 с.

    Патенты

    1. Патент № 2744025 от 02.03.2021 Способ диагностики рецепторного профиля эндометрия в абортном материале беременности раннего срока. Т.Г. Траль, Г.Х. Толибова, А.А. Олина, И.Ю. Коган.
    2. Патент № 2610536 от 13.02.2017 Способ моделирования острого жирового гепатоза беременных. Петросян М.А., Жесткова Н.В., Балашова Н.Н., Полянских Л.С., Тумасова Ж.Н., Разыграев А.В., Траль Т.Г., Айламазян Э.К.
    3. Патент № 2511107 от 26.12.2021 Способ моделирования иммунопатологической плацентарной недостаточности. Бородина Е.С., Бланк М., Чурилов Л.П., Острински Ю., Джемлиханова Л.Х, Толибова Г.Х., Траль Т.Г., Ниаури Д.А., Коган И.Ю., Гзгзян А.М., Шенфельд И.Ю.

    Публикации

    • Айламазян Э.К., Толибова Г.Х., Петросян М.А., Траль Т.Г., Сердюков С.В.. Эндометрий: от ядерных рецепторов до тест-модели новых лекарств .  Молекулярная медицина 2014; 5: 15-18.
    • Траль Т.Г., Толибова Г.Х., Морфологические и иммуногистохимические особенности неразвивающейся беременности I триместра. Журнал акушерства и женских болезней. 2014; 67: 4: 60-68.
    • Айламазян Э.К., Толибова Г.Х., Т.Г Траль, и др. Клинико-морфологические детерминанты бесплодия ассоциированного с воспалительными заболеваниями органов малого таза. Журнал акушерства и женских болезней. 2015г. 67: 6: 17- 26.
    • Айламазян Э.К., Толибова Г.Х., Траль Т.Г., Коган И.Ю. и др. Новые подходы к оценке эндометриальной дисфункции. Журнал акушерства и женских болезней. 2017: 66: 3: 8-15.
    • Bespalova Olesya, Bakleicheva Margarita, Kovaleva Irina, Tolibova Gulrukhsor, Tral Tatiana,  Kogan Igor. Expression of vitamin D and vitamin D receptor in chorionic villous in missed abortion. Gynecological Endocrinology. 2019: 35: 1: 49-55.
    • Толибова Г.Х., Траль Т.Г., Кахиани М.И., Коган И.Ю. Гиперплазия эндометрия у женщин с наружным генитальным эндометриозом и миомой матки. Российский вестник акушера-гинеколога. 2020;20(6):90–95.
    • Olesya Bespalova, Margarita Bakleicheva, Tatiana Ivashchenko, Tatiana Tral, Gulrukhsor Tolibova, Igor Kogan. Expression of HLA-G and KIR2DL4 receptor in chorionic villous in missed abortion.  Gynecological Endocrinology. 2020: 36:1: 43-47.
    • Казанцева Е.В., Траль Т.Г., Толибова Г.Х. Клинико-анамнестические данные и морфофункциональные особенности эндометрия у женщин с аномалиями развития матки // Журнал акушерства и женских болезней. 2021: 70: 2: 5–12.
    • Roman V. Kapustin., Ekaterina V. Kopteeva., Elena N. Alekseenkova., Tatyana G. Tral., Gulrukhsor Kh. Tolibova., Olga N. Arzhanova Placental expression of endoglin,placental growth factor, leptin, and hypoxia-inducible factor-1 in diabetic pregnancy and preeclampsia.  Gynecological Endocrinology. 2021: 37:1: 35-39.
    • Траль Т.Г., Толибова Г.Х. Морфологические варианты гравидарной трансформации эндометрия при неразвивающейся беременности после экстракорпорального оплодотворения. Клин. эксп. морфология. 2021;10(5): 42–51.
    • Казанцева Е.В., Толибова Г.Х. , Траль Т.Г., Коган И.Ю.  Экспрессия рецептора антимюллерового гормона (AMHR2) в эндометрии пациенток с аномалиями развития матки.  Журнал акушерства и женских болезней.  2021: 70: 6: 33-40.
    • Траль Т.Г., Толибова Г.Х. Верификация стромального клеточного фактора в гравидарном эндометрии при неразвивающейся беременности после ЭКО.  Морфологические ведомости. 2022;30(1):9-17.

    Уникальное оборудование

    Лазерный конфокальный сканирующий микроскоп Olympus FV10i (Япония); Цитологический процессор NOVAPREP® NPS (Франция).

    Научные школы

    Научные школы по морфологической диагностике эндометрия и абортивного материала.

    Виварий с операционной

    Виварий обеспечивает доставку лабораторных животных из ФГУП «Питомник лабораторных животных «Рапполово» РАМН» (Ленинградская область), уход, содержание и утилизацию животных после завершения экспериментов. В экспериментах используются линейные и беспородные животные нескольких видов: кролики, крысы, мыши, морские свинки. Каждый вид содержится в специализированных клетках. Условия вивария обеспечивают выполнение задач испытаний согласно требованиям правил качественной лабораторной практики РФ (GLP).

  • Группа биохимии

  • Научный отдел

  • Международный отдел

  • Диссертационный совет

  • Научная библиотека

    Научная библиотека существует со дня основания Института. Первые упоминания о библиотеке относятся к 1844 году. В этот период времени должность репетитора исполнял врач Вейденбаум, в обязанности которого входили и функции библиотекаря (Сто лет деятельности Императорского клинического повивального института 1797 —1897 г.: историко-медицинский очерк / сост. Д.О.Отт. — С.-Петербург, 1898. — С.29).

    При разработке проекта нового здания Института Д.О.Отт особое внимание уделял помещениям для библиотеки, которая состояла из двух помещений: читального зала и основного книгохранилища, и была оборудована специальными шкафами с раздвижными дверцами и передвижными полками системы Штендера; расположение книг — систематическое.

    Одним из главных источников её формирования и пополнения были пожертвования читателей. В библиотеке хранятся редкие книги XVII–XIX веков. Дары ученых являлись источником пополнения фондов библиотеки. Интерьеры библиотеки и традиция дарения книг, выдающимися учеными Института, сохранились до наших дней.

    Сегодня, бережно сохраняя традиции, в библиотеке развиваются современные информационные технологии. Раритетные издания, бережно сохраняются в специальном отделе редких изданий. В отдельный раздел выделены издания с автографами Д.О.Отта.

    С большой любовью и заботой сохраняются интерьеры библиотеки, которые не изменились с момента создания нового здания Института. Основные каталоги библиотеки: систематический и алфавитный, существуют со дня образования постоянного книжного фонда, который, в соответствии с каталогами, имеет систематическое расположение книг.

    Основные фонды насчитывают более 80000 единиц хранения и имеют систематическое деление.

    Научная библиотека сотрудничает с ведущими медицинскими издательствами России, что позволяет комплектовать фонды современной литературой.

    С 1994 г. в библиотеке ведётся электронный каталог. Читатели могут пользоваться всеми доступными электронными базами через Internet.

    Фондами библиотеки, которые отражают все современные публикации по акушерству и гинекологии, могут пользоваться не только читатели северо-запада, но и других регионов России и зарубежных стран.

    Основные разделы фонда (систематическое деление)

    1—3 (Философия, религия, политика)
    53 Математика
    Медицина:
    57 Биология, генетика
    611 Анатомия, гистология эмбриология
    612 Физиология
    613 Гигиена, питание
    614 Здравоохранение, статистика
    615 Фармакология
    615.8 Рентгенология
    615.81 Физиотерапия, курортология
    615.9 Токсикология, ГО
    616 Терапия
    616.1 Кровь, сердце, сосуды
    616.2 Органы дыхания
    616.3 Пищеварение
    616.4 Эндокринология
    616.5 Дерматология
    616.6 Урология
    616.8 Неврология
    616.9 Инфекции
    617 Хирургия (онкология, переливание крови)
    618.1/.2 Акушерство, гинекология
    618.9 Педиатрия
    9 Биографии(история)